23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0335 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0335  DNA polymerase III, delta subunit superfamily  100 
 
 
305 aa  594  1e-169  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.874049  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  19.88 
 
 
336 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  19.88 
 
 
336 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  19.28 
 
 
336 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  19.28 
 
 
336 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  19.28 
 
 
336 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  19.28 
 
 
336 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  19.28 
 
 
336 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  24.21 
 
 
324 aa  52  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  19.28 
 
 
336 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  19.28 
 
 
336 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  18.67 
 
 
336 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  19.28 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  15.93 
 
 
348 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  17.41 
 
 
344 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  21.71 
 
 
323 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  24.62 
 
 
354 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  22.02 
 
 
324 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  22.02 
 
 
324 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  18.06 
 
 
325 aa  46.2  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1819  DNA polymerase III subunit delta  23.44 
 
 
334 aa  44.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0075815  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  18.03 
 
 
332 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  22.34 
 
 
344 aa  43.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>