54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0423 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0438  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  564  1e-160  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0423  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  564  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1809  hypothetical protein  58.45 
 
 
288 aa  338  7e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.305818  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0912  protein of unknown function DUF125 transmembrane  53.36 
 
 
291 aa  299  4e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1272  hypothetical protein  54.58 
 
 
291 aa  295  5e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1572  protein of unknown function DUF125 transmembrane  52.28 
 
 
291 aa  285  5.999999999999999e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.493606  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0860  hypothetical protein  54.39 
 
 
293 aa  285  7e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.110107  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1653  hypothetical protein  49.47 
 
 
291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.850435  normal  0.0303841 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1196  protein of unknown function DUF125 transmembrane  50 
 
 
285 aa  282  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0801  protein of unknown function DUF125 transmembrane  49.65 
 
 
291 aa  280  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1189  hypothetical protein  48.94 
 
 
291 aa  278  7e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1514  hypothetical protein  53.6 
 
 
292 aa  276  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671391  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1070  hypothetical protein  49.08 
 
 
292 aa  265  5.999999999999999e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1685  protein of unknown function DUF125 transmembrane  53.24 
 
 
289 aa  265  8e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0215  protein of unknown function DUF125 transmembrane  48.75 
 
 
300 aa  258  6e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1173  protein of unknown function DUF125 transmembrane  45.64 
 
 
293 aa  249  3e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01890  uncharacterized membrane protein  51.41 
 
 
297 aa  247  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1049  hypothetical protein  45.91 
 
 
293 aa  236  2e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2800  protein of unknown function DUF125 transmembrane  46.08 
 
 
292 aa  230  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.792813  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0331  hypothetical protein  39.35 
 
 
287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.464299  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0704  hypothetical protein  33.79 
 
 
299 aa  154  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.258152  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1758  hypothetical protein  34.39 
 
 
297 aa  154  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0216697  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0774  hypothetical protein  34.04 
 
 
297 aa  151  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.443952 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0496  hypothetical protein  31.91 
 
 
299 aa  145  5e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1650  hypothetical protein  30.42 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.381623  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0835  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.03 
 
 
358 aa  101  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1094  hypothetical protein  33.85 
 
 
374 aa  91.7  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0379  hypothetical protein  25.42 
 
 
362 aa  92  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1468  protein of unknown function DUF125 transmembrane  24.72 
 
 
361 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181021  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0378  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.65 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0516728  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  29.95 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04290  uncharacterized membrane protein  28.49 
 
 
376 aa  69.7  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0844  hypothetical protein  28.65 
 
 
387 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.07 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0962  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.94 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01320  uncharacterized membrane protein  28.64 
 
 
365 aa  65.9  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1689  hypothetical protein  33.33 
 
 
383 aa  59.7  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3216  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.77 
 
 
389 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000032928 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  32.37 
 
 
401 aa  57  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.171497  normal  0.932385 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0161  protein of unknown function DUF125 transmembrane  29.89 
 
 
399 aa  53.9  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279325  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0522  hypothetical protein  24.57 
 
 
319 aa  52  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.655797  normal  0.060241 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19590  uncharacterized membrane protein  37.31 
 
 
232 aa  48.5  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.927854  normal  0.04221 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2558  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.97 
 
 
181 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0592  hypothetical protein  36.23 
 
 
227 aa  47  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000251129  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5110  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.5 
 
 
238 aa  46.2  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1508  hypothetical protein  34.72 
 
 
230 aa  45.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00139077  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0798  hypothetical protein  38.33 
 
 
226 aa  44.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0236  hypothetical protein  37.7 
 
 
343 aa  43.9  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1792  hypothetical protein  36.92 
 
 
227 aa  43.5  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0481  hypothetical protein  36.92 
 
 
227 aa  43.5  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00758654  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4967  hypothetical protein  33.9 
 
 
231 aa  43.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794952  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1266  rubrerythrin  25.25 
 
 
327 aa  42.7  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0698  hypothetical protein  35.71 
 
 
233 aa  42.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0494  hypothetical protein  34.33 
 
 
227 aa  42.4  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.167313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>