More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0379 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0395  malate dehydrogenase  99.47 
 
 		 376 aa  759    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0379  malate dehydrogenase  100 
 
 		 376 aa  762    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0949  malate dehydrogenase  68.62 
 
 		 379 aa  554  1e-157  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0471  malate dehydrogenase  65.58 
 
 		 376 aa  483  1e-135  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122448  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1956  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  55.15 
 
 		 390 aa  397  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0967  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  55.34 
 
 		 407 aa  389  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1919  malate oxidoreductase  58.38 
 
 		 387 aa  390  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000616521  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2232  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  56.13 
 
 		 478 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0169  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  56.08 
 
 		 387 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0409  malate dehydrogenase  54.13 
 
 		 383 aa  383  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192997  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1376  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  55.86 
 
 		 478 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000390692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0642  malate dehydrogenase, putative  51.85 
 
 		 399 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0492  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  52.12 
 
 		 399 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0215  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  53.02 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.984607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0617  putative malate dehydrogenase  52.38 
 
 		 399 aa  378  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4722  putative malate dehydrogenase  52.12 
 
 		 399 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0548  malate dehydrogenase  51.85 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2923  malate dehydrogenase  53.95 
 
 		 414 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440621  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0490  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  51.85 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0579  malate dehydrogenase  51.85 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3145  malate dehydrogenase  53.95 
 
 		 414 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0635  putative malate dehydrogenase  51.85 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2399  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  49.74 
 
 		 399 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000325026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3134  putative malate dehydrogenase  53.41 
 
 		 414 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0229  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  50.8 
 
 		 384 aa  364  1e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10070  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  52.6 
 
 		 407 aa  362  4e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000523345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0493  malate dehydrogenase  52.51 
 
 		 400 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0409  malate dehydrogenase  53.11 
 
 		 403 aa  362  8e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0902  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  53.41 
 
 		 411 aa  359  5e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0499  malate dehydrogenase  52.88 
 
 		 401 aa  358  6e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1110  malate dehydrogenase  51.96 
 
 		 481 aa  357  9.999999999999999e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421684  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08210  malic enzyme  50 
 
 		 474 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3045  NAD-dependent malic enzyme  50.27 
 
 		 427 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.900825  normal  0.491141 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0830  malate dehydrogenase  52.16 
 
 		 403 aa  355  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.313277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0113  malate dehydrogenase  51.76 
 
 		 457 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191166  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1758  malate dehydrogenase  49.6 
 
 		 409 aa  351  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1792  malate dehydrogenase  49.6 
 
 		 409 aa  351  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3355  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  54.97 
 
 		 492 aa  348  6e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2286  malate dehydrogenase  50.55 
 
 		 474 aa  348  6e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4433  malate dehydrogenase  51.72 
 
 		 412 aa  347  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3211  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  51.69 
 
 		 481 aa  347  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0622  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  50.27 
 
 		 460 aa  346  3e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2141  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  51.81 
 
 		 474 aa  346  4e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0344  malate dehydrogenase  48.5 
 
 		 390 aa  344  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318957  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2490  malate dehydrogenase  50.68 
 
 		 473 aa  345  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.148029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4713  putative malate dehydrogenase  51.19 
 
 		 412 aa  344  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1265  NADP-dependent malic enzyme, putative  48.16 
 
 		 409 aa  343  2e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3432  malate dehydrogenase  50.84 
 
 		 479 aa  344  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0524  putative malate dehydrogenase  51.19 
 
 		 412 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0242  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  47.53 
 
 		 414 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4734  malate dehydrogenase, putative  51.19 
 
 		 412 aa  343  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4497  malate dehydrogenase  51.19 
 
 		 412 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4332  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  51.19 
 
 		 412 aa  343  4e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4729  putative malate dehydrogenase  51.19 
 
 		 412 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4718  putative malate dehydrogenase  51.19 
 
 		 412 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1271  malate dehydrogenase  49.33 
 
 		 386 aa  342  5e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000347822  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2371  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  53.97 
 
 		 405 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0140  NAD-dependent malic enzyme  50.82 
 
 		 390 aa  342  5.999999999999999e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174768  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1062  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  51.19 
 
 		 407 aa  342  8e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00425454  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1089  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  49.06 
 
 		 409 aa  342  9e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.864025  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3287  malate dehydrogenase  51.45 
 
 		 412 aa  341  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1912  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  52.05 
 
 		 402 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0366  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  49.32 
 
 		 468 aa  340  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1195  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  49.08 
 
 		 463 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232421 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2866  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  48.91 
 
 		 489 aa  339  4e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0465  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  50.82 
 
 		 467 aa  339  4e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4344  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  51.2 
 
 		 402 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4848  malate dehydrogenase  51.2 
 
 		 402 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34210  malic enzyme  49.86 
 
 		 466 aa  339  5.9999999999999996e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10480  malic enzyme  50.4 
 
 		 493 aa  337  9.999999999999999e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.549836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2458  amino acid-binding ACT  49.72 
 
 		 463 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0212  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  51.54 
 
 		 500 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.455099  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0138  malic protein NAD-binding  49.59 
 
 		 391 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000809828  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0896  malate dehydrogenase  46.93 
 
 		 381 aa  334  1e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.662233  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0401  malate dehydrogenase  50.83 
 
 		 407 aa  333  4e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00944416 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0140  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  51.08 
 
 		 503 aa  332  5e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0985  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  48.4 
 
 		 433 aa  332  5e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000205214  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1316  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  47.17 
 
 		 381 aa  332  7.000000000000001e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.034067  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3085  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  49.32 
 
 		 418 aa  332  8e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000232423  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2390  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating)  49.59 
 
 		 470 aa  331  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3203  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  48.54 
 
 		 463 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2893  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  48.54 
 
 		 463 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2900  malate dehydrogenase  48.54 
 
 		 394 aa  329  4e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2803  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  48.03 
 
 		 484 aa  328  8e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533173  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0562  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating)  48.35 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1467  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  49.87 
 
 		 470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1656  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  48.9 
 
 		 463 aa  328  1.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.965749  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20210  malic enzyme  49.46 
 
 		 485 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33400  malic enzyme  47.91 
 
 		 473 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.513398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1297  malate dehydrogenase  47.51 
 
 		 469 aa  327  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.428219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05030  malic enzyme  51.52 
 
 		 390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3983  malate dehydrogenase  49.45 
 
 		 462 aa  326  4.0000000000000003e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2034  malate dehydrogenase  48.52 
 
 		 461 aa  326  5e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4565  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  48.64 
 
 		 476 aa  325  8.000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.423371  normal  0.479967 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0147  malate dehydrogenase  47.44 
 
 		 402 aa  324  2e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3684  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  48.9 
 
 		 399 aa  323  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.502842  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5158  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  51.27 
 
 		 386 aa  323  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1419  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  50.28 
 
 		 411 aa  323  4e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1647  malate dehydrogenase  44.99 
 
 		 504 aa  322  5e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1448  malate dehydrogenase  50 
 
 		 513 aa  321  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.320703  normal  0.623093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>