42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0267 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0267  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  293  5e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0194677  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0265  hypothetical protein  91.61 
 
 
143 aa  272  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0984626  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0815  hypothetical protein  45.61 
 
 
127 aa  92.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1424  hypothetical protein  37.98 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149794  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.26 
 
 
356 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  37.39 
 
 
356 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.39 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.39 
 
 
356 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.83 
 
 
357 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0507  hypothetical protein  35.34 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0319472  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1462  protein of unknown function DUF123  33.62 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0479  protein of unknown function DUF123  31.25 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0625  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0654  protein of unknown function DUF123  33.33 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1312  hypothetical protein  31.78 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.474029 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3196  protein of unknown function DUF123  38.26 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1482  hypothetical protein  32.77 
 
 
120 aa  54.3  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0956236  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0937  protein of unknown function DUF123  31.53 
 
 
128 aa  54.7  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.305351  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0898  protein of unknown function DUF123  30.88 
 
 
137 aa  52.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0253075  normal  0.780245 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0198  hypothetical protein  32.52 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000406548  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0792  hypothetical protein  28.87 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0013461 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02280  hypothetical protein  34.23 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273401  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0260  hypothetical protein  28.92 
 
 
197 aa  50.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0029368  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2695  hypothetical protein  36.97 
 
 
188 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2461  hypothetical protein  35.48 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1962  hypothetical protein  31.63 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0360  hypothetical protein  29.87 
 
 
197 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0611863  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0871  hypothetical protein  32.95 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1038  hypothetical protein  29.81 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.4343 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1958  hypothetical protein  25.81 
 
 
115 aa  47  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0334  hypothetical protein  26.95 
 
 
208 aa  47  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.804201  normal  0.829767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1232  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0278  protein of unknown function DUF123  26.72 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0991873  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0646  hypothetical protein  30.09 
 
 
154 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.269467  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0396  endonuclease III  26.72 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1807  hypothetical protein  28.09 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796576  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0067  hypothetical protein  29.6 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3380  protein of unknown function DUF123  31.9 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798744  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0042  hypothetical protein  28.77 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.899596  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0338  hypothetical protein  25.15 
 
 
189 aa  42  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0278088  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2610  hypothetical protein  28.4 
 
 
192 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0776  protein of unknown function DUF123  31.91 
 
 
158 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>