14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1604 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1604  nuclease  100 
 
 		 168 aa  336  9.999999999999999e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3899  hypothetical protein  39.84 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1066  nuclease  39.55 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8477  ParB domain protein nuclease  39.06 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00870  hypothetical protein  35.94 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123974  normal  0.579728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6955  ParB domain protein nuclease  43.56 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.92637  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0631  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3687  hypothetical protein  32.82 
 
 		 159 aa  72  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.726318  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0583  ParB-like nuclease  33.6 
 
 		 130 aa  67  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000149246  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2111  nuclease  38.67 
 
 		 193 aa  50.8  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1089  ParB domain protein nuclease  28.4 
 
 		 194 aa  47.8  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.767607  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0280  paREP1  31.71 
 
 		 273 aa  47.8  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.216208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1545  paREP1  32.81 
 
 		 280 aa  45.8  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.972627 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1373  paREP1  31.71 
 
 		 278 aa  44.7  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>