14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1397 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1397  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 171 aa  328  3e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0596  DNA polymerase beta domain protein region  51.76 
 
 		 174 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0115055  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  39.24 
 
 		 155 aa  101  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0998  DNA polymerase beta subunit  37.67 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0594708  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3917  hypothetical protein  35 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.038879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0018  DNA polymerase beta domain protein region  38.1 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4164  DNA polymerase beta domain protein region  26.36 
 
 		 113 aa  45.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  29.66 
 
 		 122 aa  43.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2550  DNA polymerase beta domain protein region  40.96 
 
 		 230 aa  42  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0464694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1449  hypothetical protein  27.59 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224233 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0678  DNA polymerase beta domain protein region  26 
 
 		 114 aa  41.6  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000111019  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1643  DNA polymerase beta domain protein region  36 
 
 		 115 aa  41.2  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4035  DNA polymerase beta domain protein region  30.14 
 
 		 113 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6110  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 303 aa  41.2  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>