More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3763 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3763  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  100 
 
 
336 aa  692    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  84.08 
 
 
338 aa  595  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0532  luciferase-like protein  78.57 
 
 
336 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0544  luciferase family protein  78.57 
 
 
336 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00841212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0522  luciferase family protein  78.57 
 
 
336 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  78.57 
 
 
336 aa  557  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  77.08 
 
 
336 aa  548  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  76.79 
 
 
336 aa  544  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  64.85 
 
 
337 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  59.34 
 
 
339 aa  413  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  55.89 
 
 
336 aa  383  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  54.35 
 
 
342 aa  352  4e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4102  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  50.3 
 
 
331 aa  338  7e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal  0.155147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4148  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  50.3 
 
 
331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168027  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24550  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.23 
 
 
329 aa  216  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0420  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase  34.04 
 
 
342 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1412  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  37.09 
 
 
333 aa  210  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349284  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5308  Luciferase-like monooxygenase  34.64 
 
 
329 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406576  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2587  Luciferase-like monooxygenase  36.94 
 
 
332 aa  208  8e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  35.06 
 
 
332 aa  208  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0783  luciferase family protein  34.34 
 
 
330 aa  205  7e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0447629  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3981  luciferase family protein  36.67 
 
 
329 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0510411 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1130  Luciferase-like monooxygenase  35.63 
 
 
332 aa  205  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.74 
 
 
332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.986731 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4584  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  37.24 
 
 
321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0208  Luciferase-like monooxygenase  34.62 
 
 
333 aa  200  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1140  luciferase family protein  36.36 
 
 
332 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  33.84 
 
 
334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1142  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  33.12 
 
 
318 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  31.71 
 
 
335 aa  194  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5802  putative dehydrogenase protein  35.01 
 
 
322 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  39.02 
 
 
360 aa  190  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4387  Luciferase-like, subgroup  32.56 
 
 
339 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.128943  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3680  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  35.31 
 
 
322 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0326  Luciferase-like monooxygenase  33.03 
 
 
325 aa  186  6e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0484  luciferase-like protein  34.33 
 
 
330 aa  185  7e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.573719  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1669  hypothetical protein  35.95 
 
 
321 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2747  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  36.87 
 
 
321 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1188  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  31.33 
 
 
318 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  32.05 
 
 
322 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0382  luciferase-like monooxygenase  34.23 
 
 
320 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18990  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.61 
 
 
325 aa  176  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.873493  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3301  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  30.51 
 
 
318 aa  175  9e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0670  Luciferase-like monooxygenase  32.93 
 
 
318 aa  175  9e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3201  luciferase-like protein  34.43 
 
 
320 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4866  Luciferase-like monooxygenase  33.93 
 
 
324 aa  165  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00773357  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2479  Luciferase-like monooxygenase  34.53 
 
 
331 aa  162  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000324346  hitchhiker  0.00415555 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4037  putative dehydrogenase protein  35.44 
 
 
323 aa  162  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122035  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6790  luciferase family protein  36.92 
 
 
322 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1586  luciferase family protein  32.65 
 
 
503 aa  159  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.648959  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5098  Luciferase-like monooxygenase  33.24 
 
 
379 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1544  luciferase family protein  31.75 
 
 
320 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0708084  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0743  luciferase family protein  30.91 
 
 
320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4944  luciferase family protein  32.65 
 
 
330 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0922  luciferase family protein  31.78 
 
 
338 aa  153  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188531  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5223  luciferase family protein  32.94 
 
 
330 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.018076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4855  luciferase-like protein  32.65 
 
 
341 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5026  Luciferase-like monooxygenase  31.94 
 
 
326 aa  152  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.798611  normal  0.182445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4853  Luciferase-like monooxygenase  33.64 
 
 
321 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00131867  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1366  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  33.73 
 
 
321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4851  Luciferase-like monooxygenase  33.43 
 
 
321 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0116346  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1341  luciferase family protein  32.25 
 
 
328 aa  152  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.973005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5448  luciferase family protein  42.53 
 
 
328 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4126  luciferase family protein  31.86 
 
 
334 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3215  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  32.34 
 
 
334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.912024  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3627  dehydrogenase  33.23 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5578  putative dehydrogenase protein  32.14 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2231  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  31.4 
 
 
321 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6346  luciferase family protein  32.29 
 
 
343 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310691  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0280  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  42.29 
 
 
260 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4087  putative dehydrogenase protein  30.06 
 
 
328 aa  143  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7147  Luciferase-like monooxygenase  31.97 
 
 
343 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348721  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5283  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  29.64 
 
 
326 aa  136  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7870  putative dehydrogenase protein  30.61 
 
 
318 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1273  putative dehydrogenase protein  30.09 
 
 
320 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3081  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  31.04 
 
 
349 aa  132  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.903709  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3709  Luciferase-like monooxygenase  30.95 
 
 
325 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1435  putative dehydrogenase protein  31 
 
 
320 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1275  putative dehydrogenase protein  31 
 
 
320 aa  123  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5600  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  27.25 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421173 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8019  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  26.28 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3722  putative dehydrogenase protein  30.49 
 
 
325 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0414555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4597  putative dehydrogenase protein  30.3 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4685  putative dehydrogenase protein  30.3 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348286  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4980  putative dehydrogenase protein  30.3 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  26.78 
 
 
328 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3224  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  29.03 
 
 
343 aa  92.8  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000991835 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  30.65 
 
 
364 aa  90.5  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25 
 
 
345 aa  89.4  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.21 
 
 
314 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
336 aa  86.3  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  35.56 
 
 
293 aa  85.9  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  28.89 
 
 
338 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2107  Luciferase-like monooxygenase  25.69 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4599  Luciferase-like monooxygenase  30.22 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  35.23 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  29.25 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  25.26 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0981  Luciferase-like monooxygenase  25.08 
 
 
332 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6834  luciferase family protein  27.04 
 
 
327 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>