23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2204 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2204  Abortive infection protein  100 
 
 		 204 aa  387  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5117  abortive infection protein  45.87 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0210896  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4544  abortive infection protein  37.13 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4631  abortive infection protein  37.13 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4927  abortive infection protein  37.13 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.374619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1632  abortive infection protein  43.08 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10819  hypothetical protein  39.25 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.207156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2794  abortive infection protein  35.14 
 
 		 244 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2838  abortive infection protein  35.14 
 
 		 244 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2821  abortive infection protein  35.14 
 
 		 244 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3342  abortive infection protein  34.51 
 
 		 253 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11891  integral membrane protein  34.23 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.413388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3070  abortive infection protein  35.14 
 
 		 253 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.715481  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1983  Abortive infection protein  33.04 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00182843  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5235  Abortive infection protein  34.23 
 
 		 241 aa  45.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  38.3 
 
 		 308 aa  45.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3058  Abortive infection protein  31.13 
 
 		 255 aa  45.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5184  hypothetical protein  32.95 
 
 		 280 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0151548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2722  Abortive infection protein  31.13 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3181  hypothetical protein  36.46 
 
 		 287 aa  42.4  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  26.56 
 
 		 299 aa  42  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0281  abortive infection protein  34.41 
 
 		 289 aa  42  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2427  Abortive infection protein  30.97 
 
 		 225 aa  41.6  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.856129 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>