More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1983 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1983  fmnh2-utilizing oxygenase  100 
 
 		 448 aa  896    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105914  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1592  monooxygenase  64.09 
 
 		 521 aa  552  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.147927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3486  putative oxygenase  63.29 
 
 		 451 aa  548  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  64.49 
 
 		 469 aa  543  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.339029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3877  monooxygenase  62.16 
 
 		 441 aa  532  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2017  putative FMNH2-utilizing oxygenase  61.17 
 
 		 455 aa  507  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0632006  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3795  FMNH2-utilizing oxygenase  59.45 
 
 		 458 aa  498  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6191  monooxygenase  63.27 
 
 		 428 aa  497  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0618693  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4352  monooxygenase  59.56 
 
 		 471 aa  498  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7210  monooxygenase  55.56 
 
 		 444 aa  473  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0931  putative nitrilotriacetate monoxygenase, component A  52.57 
 
 		 442 aa  421  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.027595  normal  0.0155722 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0294  putative monooxygenase  50.44 
 
 		 475 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3904  putative oxygenase  49.42 
 
 		 460 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3704  putative monooxygenase  49.19 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02230  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  48.33 
 
 		 458 aa  375  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  40.27 
 
 		 457 aa  306  6e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4330  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  40.8 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  40.69 
 
 		 452 aa  291  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  40.54 
 
 		 445 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  39.95 
 
 		 445 aa  286  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  38.02 
 
 		 452 aa  285  8e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  38.15 
 
 		 453 aa  284  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6386  monooxygenase protein  40.31 
 
 		 450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.0362961 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5176  monooxygenase  38.74 
 
 		 429 aa  283  5.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  39.06 
 
 		 450 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4857  nitrilotriacetate monooxygenase component A  39.86 
 
 		 449 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140464  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  38.1 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  38.6 
 
 		 458 aa  280  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21890  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  42.28 
 
 		 443 aa  279  6e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2024  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  39.38 
 
 		 460 aa  279  7e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  38.72 
 
 		 457 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2176  nitrilotriacetate monooxygenase component A  40.55 
 
 		 445 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0770  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  39.73 
 
 		 450 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4542  putative monooxygenase protein  39.87 
 
 		 450 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0938197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4737  nitrilotriacetate monooxygenase component A  39.4 
 
 		 441 aa  276  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  37.53 
 
 		 446 aa  275  9e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3332  putative monooxygenase  38.93 
 
 		 451 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2156  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  38.13 
 
 		 458 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0118  putative monooxygenase  39.64 
 
 		 445 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5298  Nrd protein  39.96 
 
 		 461 aa  272  9e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826228  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3282  nitrilotriacetate monooxygenase component A  39.42 
 
 		 459 aa  272  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8274  monooxygenase  39.47 
 
 		 442 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.104481 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1172  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  37.64 
 
 		 451 aa  270  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259723  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2425  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  39.16 
 
 		 448 aa  270  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109543  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6152  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  39.04 
 
 		 444 aa  270  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  hitchhiker  0.000273361 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5007  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  38.29 
 
 		 442 aa  270  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3891  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.78 
 
 		 439 aa  269  8.999999999999999e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.68944  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3452  putative monooxygenase  38.24 
 
 		 447 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752171 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  38.5 
 
 		 448 aa  266  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0349  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  39.51 
 
 		 441 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0906  nitrilotriacetate monooxygenase component A  37.19 
 
 		 441 aa  266  5.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457793  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3854  putative monooxygenase  37.93 
 
 		 492 aa  266  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.436036  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  38.57 
 
 		 449 aa  266  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0251  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  38.85 
 
 		 439 aa  266  7e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21740  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  39.59 
 
 		 442 aa  266  8e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.77772  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5125  putative monooxygenase protein  38.98 
 
 		 450 aa  266  8e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2211  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  38.94 
 
 		 448 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284835  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  38.8 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1693  putative monooxygenase  39.64 
 
 		 449 aa  265  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0841245  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  37.13 
 
 		 441 aa  264  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5093  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  38.26 
 
 		 445 aa  264  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0268  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  38.11 
 
 		 448 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  39.91 
 
 		 448 aa  263  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0526  hypothetical protein  37.78 
 
 		 451 aa  262  8e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2149  hypothetical protein  38.81 
 
 		 442 aa  262  8e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0408  hypothetical protein  38.29 
 
 		 458 aa  262  8e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21660  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  39.04 
 
 		 441 aa  262  8e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.714961  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  38.13 
 
 		 474 aa  261  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2090  hypothetical protein  37.56 
 
 		 438 aa  261  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.59319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2535  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  38.05 
 
 		 444 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354477  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  36.22 
 
 		 448 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  35.28 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2489  hypothetical protein  38.33 
 
 		 442 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2568  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  38.22 
 
 		 447 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1851  nitrilotriacetate monooxygenase component A  37.47 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7195  monooxygenase  38.11 
 
 		 443 aa  259  6e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0485069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1187  hypothetical protein  37.58 
 
 		 441 aa  259  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0433  monooxygenase  39.31 
 
 		 472 aa  259  7e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  39.84 
 
 		 434 aa  259  7e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6653  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  36.89 
 
 		 448 aa  259  9e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.743567  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1558  nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  36.46 
 
 		 458 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1908  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  38.55 
 
 		 454 aa  258  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4938  putative monooxygenase  40.97 
 
 		 451 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  36.81 
 
 		 444 aa  256  5e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3311  Nrd protein  37.47 
 
 		 457 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  34.76 
 
 		 440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2378  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  36.69 
 
 		 440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  37.03 
 
 		 444 aa  254  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1773  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  36.17 
 
 		 448 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.702307  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05546  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  37.56 
 
 		 1121 aa  252  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43930  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  37.28 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4307  putative nitrilotriacetate monooxygenase  38.67 
 
 		 449 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355403  hitchhiker  0.00147548 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2295  nitrilotriacetate monooxygenase component A  35.98 
 
 		 449 aa  249  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1697  flavin-dependent oxidoreductase  37.39 
 
 		 447 aa  249  7e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.368997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0160  putative monooxygenase  35.65 
 
 		 469 aa  249  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4844  Nrd protein  37.44 
 
 		 448 aa  249  9e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1369  luciferase-like protein  37.64 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2448  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  38.3 
 
 		 495 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3782  nitrilotriacetate monooxygenase  36.53 
 
 		 455 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1255  nitrilotriacetate monooxygenase component A  38.3 
 
 		 468 aa  247  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>