87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0246 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0246  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
896 aa  1805    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7441  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.01 
 
 
873 aa  282  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4731  serine/threonine protein kinase  31.29 
 
 
839 aa  278  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1322  serine/threonine protein kinase  29.75 
 
 
854 aa  272  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.198342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4239  serine/threonine protein kinase  30.32 
 
 
870 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.129561 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1744  serine/threonine protein kinase  25.79 
 
 
860 aa  264  6e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00380667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6433  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.49 
 
 
878 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642211  normal  0.0697587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0532  serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 
853 aa  253  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.332532 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3610  serine/threonine protein kinase  30.92 
 
 
866 aa  252  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.561944  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4848  serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 
880 aa  240  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7172  serine/threonine protein kinase  28.17 
 
 
861 aa  186  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4758  serine/threonine protein kinase, putative  23.18 
 
 
838 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000666058  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1920  hypothetical protein  28.25 
 
 
719 aa  102  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2130  serine/threonine protein kinase  25.66 
 
 
894 aa  95.9  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0710537  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0598  serine/threonine protein kinase  30.51 
 
 
864 aa  94.7  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0376  serine/threonine protein kinase  28.78 
 
 
865 aa  93.6  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2549  Serine/threonine protein kinase  24.02 
 
 
614 aa  89  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2497  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
880 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0417  serine/threonine protein kinase  34.45 
 
 
412 aa  64.7  0.000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0201  serine/threonine protein kinase  26.03 
 
 
729 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  28.23 
 
 
599 aa  56.2  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0335  serine/threonine protein kinase  30.61 
 
 
671 aa  55.5  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656897  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  25.13 
 
 
761 aa  55.1  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.56 
 
 
598 aa  53.9  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  28.73 
 
 
571 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5606  serine/threonine protein kinase  25.77 
 
 
483 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442133  normal  0.281966 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  28.06 
 
 
507 aa  53.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.79 
 
 
551 aa  53.5  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0794  serine/threonine protein kinase  26.47 
 
 
623 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.779291  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0809  protein kinase  26.47 
 
 
623 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.386876  normal  0.0684467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  29.23 
 
 
517 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0789  protein kinase  26.47 
 
 
621 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.83 
 
 
591 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0677  serine/threonine protein kinase  28.65 
 
 
898 aa  52.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000321455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  28.03 
 
 
593 aa  52  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 
666 aa  50.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  31.63 
 
 
1383 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.35 
 
 
438 aa  50.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0541  serine/threonine protein kinase  26.77 
 
 
627 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1579  serine/threonine protein kinase  26.98 
 
 
761 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.222846  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  27.03 
 
 
571 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2064  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.65 
 
 
662 aa  49.7  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  22 
 
 
415 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  27.7 
 
 
571 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.79 
 
 
880 aa  49.3  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  22.02 
 
 
637 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4114  serine/threonine protein kinase  27.63 
 
 
513 aa  48.9  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0600748  normal  0.0166963 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  26.03 
 
 
651 aa  48.5  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4118  serine/threonine protein kinase  28.66 
 
 
888 aa  48.5  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.116559  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15820  serine/threonine protein kinase  27.93 
 
 
721 aa  47.8  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0718778 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0135  serine/threonine protein kinase  29.58 
 
 
562 aa  47.8  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.340026 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
612 aa  48.1  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  24.16 
 
 
641 aa  47.8  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1698  serine/threonine protein kinase  28.87 
 
 
461 aa  46.2  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00790624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25 
 
 
1205 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  28.79 
 
 
678 aa  47  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  27.89 
 
 
425 aa  47  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4988  serine/threonine protein kinase  23.92 
 
 
773 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0218503  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11764  anchored-membrane serine/threonine-protein kinase pknF  25.68 
 
 
476 aa  46.2  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058328 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0074  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.41 
 
 
967 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  31.82 
 
 
501 aa  46.6  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5601  serine/threonine protein kinase  27.45 
 
 
900 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  26.53 
 
 
889 aa  46.2  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  27.52 
 
 
502 aa  46.2  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.22 
 
 
653 aa  45.8  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4141  serine/threonine protein kinase  28.98 
 
 
446 aa  45.4  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  27.32 
 
 
776 aa  45.8  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  27.15 
 
 
577 aa  45.8  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2542  serine/threonine protein kinase  22.16 
 
 
447 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4944  serine/threonine protein kinase  24.8 
 
 
763 aa  45.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208032  normal  0.80492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1260  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.47 
 
 
1024 aa  45.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.822477 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1433  protein kinase  27.65 
 
 
963 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.698997  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6656  serine/threonine protein kinase  25.76 
 
 
979 aa  45.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.38837  normal  0.794447 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  27.89 
 
 
662 aa  45.4  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1528  serine/threonine protein kinase  23.29 
 
 
601 aa  45.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  27.7 
 
 
894 aa  45.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  26.04 
 
 
422 aa  44.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  26.83 
 
 
866 aa  44.7  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  25.33 
 
 
574 aa  44.7  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  27.92 
 
 
632 aa  44.7  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5031  serine/threonine protein kinase  31.75 
 
 
338 aa  44.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.270554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5635  protein kinase  26.47 
 
 
467 aa  44.7  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0045  serine/threonine protein kinase  21.61 
 
 
319 aa  44.7  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.21 
 
 
668 aa  44.7  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2172  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
509 aa  44.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  29.51 
 
 
618 aa  44.3  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.37 
 
 
1623 aa  44.3  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>