19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1929 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1929  PilT domain-containing protein  100 
 
 
114 aa  218  3e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0736  PilT domain-containing protein  71.05 
 
 
114 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2059  PilT domain-containing protein  82.73 
 
 
116 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2287  PilT domain-containing protein  74.55 
 
 
113 aa  158  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.191638 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1301  hypothetical protein  32.11 
 
 
176 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1370  hypothetical protein  31.19 
 
 
176 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0577  hypothetical protein  32.11 
 
 
176 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.26207  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1362  hypothetical protein  31.53 
 
 
171 aa  53.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.846641  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0313  hypothetical protein  29.46 
 
 
211 aa  52  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0090  hypothetical protein  35.83 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0437  PilT domain-containing protein  34.29 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0036  Nucleotide binding protein PINc  27.43 
 
 
158 aa  44.3  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0439  nucleotide binding protein  28.7 
 
 
159 aa  43.5  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000374231 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0974  nucleic acid binding protein  29.91 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.424226  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2697  Nucleotide binding protein PINc  34.13 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0273  nucleic acid binding protein  34.75 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0693481  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0130  Nucleotide binding protein PINc  30.28 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.285361  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0774  hypothetical protein  25 
 
 
158 aa  40.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000572112  hitchhiker  0.0000000000460396 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0923  PilT domain-containing protein  35.71 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.223217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>