11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0587 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0587  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 120 aa  234  3e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.838533 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0821  DNA polymerase beta subunit  60.55 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.29047 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1320  DNA polymerase beta subunit  53.57 
 
 		 137 aa  133  9e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.475196  normal  0.327189 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1502  DNA polymerase beta subunit  51.49 
 
 		 214 aa  103  7e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000371654 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1089  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.947057 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1347  DNA polymerase beta subunit  35.85 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.103374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0463  DNA polymerase beta subunit  33.67 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2641  DNA polymerase beta domain protein region  33.67 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3917  hypothetical protein  69.23 
 
 		 230 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.038879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3303  DNA polymerase beta domain protein region  77.27 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.433068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>