More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0720 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  72.11 
 
 
587 aa  847    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  62.86 
 
 
598 aa  731    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  58.04 
 
 
586 aa  653    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0720  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
587 aa  1193    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  55.82 
 
 
586 aa  622  1e-177  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  53.29 
 
 
589 aa  619  1e-176  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 
592 aa  616  1e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 
589 aa  611  1e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 
587 aa  605  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 
579 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 
579 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 
588 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  53.2 
 
 
584 aa  601  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 
585 aa  598  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 
586 aa  585  1e-166  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 
592 aa  585  1e-166  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0294  arginyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 
609 aa  579  1e-164  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 
611 aa  575  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1946  arginyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 
609 aa  546  1e-154  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2239  arginyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
609 aa  545  1e-154  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 
554 aa  509  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 
556 aa  509  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 
554 aa  510  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
554 aa  511  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 
557 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 
563 aa  501  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 
561 aa  498  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
559 aa  498  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 
570 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 
559 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
556 aa  489  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
556 aa  487  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
556 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
556 aa  488  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 
556 aa  486  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
556 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
556 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
556 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
556 aa  488  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  47 
 
 
556 aa  488  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
556 aa  484  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
556 aa  483  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2782  arginyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 
557 aa  480  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535695  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 
556 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 
564 aa  475  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 
561 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
560 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 
559 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 
551 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 
551 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0430  arginyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
594 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
551 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 
551 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4490  arginyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
561 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.703488 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
561 aa  457  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0410  arginyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
594 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0188  arginyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
594 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0084  arginyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 
594 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0592  arginyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 
594 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597736  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 
550 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0385  arginyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 
598 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603012  normal  0.077689 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1997  arginyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 
594 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3099  arginyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 
594 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2291  arginyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 
594 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0332  arginyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
567 aa  449  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.960888  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0355  arginyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
594 aa  451  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3701  arginyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
558 aa  449  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 
551 aa  452  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 
561 aa  449  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0343  arginyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
577 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401675  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
553 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
562 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0461  arginyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
561 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185336  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
553 aa  444  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0137  arginyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
596 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
553 aa  444  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 
550 aa  444  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0773  arginyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 
565 aa  444  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
575 aa  445  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0669  arginyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 
565 aa  442  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0145  arginyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
596 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1686  arginyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
575 aa  441  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0414  arginyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 
569 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.872884  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0287  arginyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
600 aa  437  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0127  arginyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
595 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2934  arginyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 
593 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
564 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0096  arginyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 
602 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2305  arginyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 
593 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2919  arginyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 
593 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0473  arginyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 
596 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6262  arginyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
593 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2831  arginyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
593 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4245  arginyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 
596 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0573  arginyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
569 aa  430  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0153  arginyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
561 aa  431  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4230  arginyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 
561 aa  431  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.228794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2968  arginyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 
593 aa  432  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 
556 aa  428  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
546 aa  426  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>