More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1568 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  100 
 
 
432 aa  866    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0344  FolC bifunctional protein  53.04 
 
 
435 aa  462  1e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  45.29 
 
 
437 aa  363  4e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  45.29 
 
 
435 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  39.22 
 
 
438 aa  290  3e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  37.96 
 
 
428 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  37.89 
 
 
429 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  37.35 
 
 
426 aa  247  4e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  37.82 
 
 
432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  36.28 
 
 
433 aa  236  7e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  34.97 
 
 
459 aa  236  7e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  37.81 
 
 
443 aa  236  9e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  36.28 
 
 
433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  36.28 
 
 
433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  36.28 
 
 
433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  35.81 
 
 
433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.28 
 
 
433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  36.11 
 
 
433 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  36.7 
 
 
441 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35.57 
 
 
433 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  32.96 
 
 
424 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  35.42 
 
 
433 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  34.59 
 
 
431 aa  232  9e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  35.83 
 
 
441 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  35.73 
 
 
424 aa  230  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.05 
 
 
433 aa  229  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35.47 
 
 
433 aa  230  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  35.75 
 
 
414 aa  228  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  34.11 
 
 
429 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  33.8 
 
 
425 aa  227  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  34.16 
 
 
451 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 
440 aa  223  4.9999999999999996e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  34.64 
 
 
431 aa  222  9e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  34.36 
 
 
422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  35.07 
 
 
463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  33.41 
 
 
427 aa  218  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  30.96 
 
 
453 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 
434 aa  216  8e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  29.7 
 
 
461 aa  215  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  32.16 
 
 
437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.89 
 
 
427 aa  213  4.9999999999999996e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  32.57 
 
 
435 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  31.54 
 
 
422 aa  210  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.6 
 
 
466 aa  210  4e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  31.87 
 
 
431 aa  210  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  34.24 
 
 
431 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3497  FolC bifunctional protein  32.04 
 
 
526 aa  205  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  32.35 
 
 
438 aa  205  1e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  32.87 
 
 
437 aa  203  4e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  34.59 
 
 
407 aa  203  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  35.12 
 
 
424 aa  203  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  33.03 
 
 
424 aa  202  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  30.61 
 
 
813 aa  202  7e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  30.16 
 
 
425 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  33.04 
 
 
447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  30.72 
 
 
422 aa  201  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  33.71 
 
 
424 aa  201  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  35.67 
 
 
428 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5271  FolC bifunctional protein  32.33 
 
 
468 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  32.72 
 
 
847 aa  199  6e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0591  FolC bifunctional protein  29.95 
 
 
474 aa  199  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  38.81 
 
 
457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0333  FolC bifunctional protein  30.48 
 
 
414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0256813  normal  0.0230172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  30.99 
 
 
452 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  31.53 
 
 
416 aa  197  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1504  folylpolyglutamate synthase / dihydrofolate synthase  32.01 
 
 
420 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000264137  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  31.06 
 
 
430 aa  196  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1218  folylpolyglutamate synthase  33.57 
 
 
419 aa  196  5.000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.672843  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0742  FolC bifunctional protein  33.7 
 
 
445 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0127305  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0087  FolC bifunctional protein  30.82 
 
 
454 aa  196  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0279686 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  32.6 
 
 
412 aa  196  7e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  31.05 
 
 
442 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23910  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.89 
 
 
466 aa  195  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.290984  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  31.67 
 
 
424 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  35.96 
 
 
425 aa  194  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3391  FolC bifunctional protein  32.91 
 
 
450 aa  193  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.44 
 
 
470 aa  193  5e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  31.24 
 
 
810 aa  193  6e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1754  FolC bifunctional protein  33.64 
 
 
423 aa  193  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.686494  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1720  FolC bifunctional protein  33.64 
 
 
423 aa  193  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.86 
 
 
422 aa  192  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  32.76 
 
 
437 aa  192  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  31.97 
 
 
465 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  31.35 
 
 
429 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2151  FolC bifunctional protein  33.94 
 
 
452 aa  190  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358705 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2554  dihydropteroate synthase  31.36 
 
 
840 aa  190  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.324611  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  32.35 
 
 
433 aa  190  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  32.35 
 
 
439 aa  189  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  31.76 
 
 
381 aa  189  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0949  FolC bifunctional protein  30.05 
 
 
433 aa  188  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1258  FolC bifunctional protein  32.97 
 
 
408 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  30.37 
 
 
428 aa  187  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  30.23 
 
 
444 aa  186  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  31.99 
 
 
413 aa  186  7e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  28.64 
 
 
817 aa  186  9e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3871  FolC bifunctional protein  30.61 
 
 
444 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1092  FolC bifunctional protein  33.92 
 
 
410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1227  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.63 
 
 
421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2605  FolC bifunctional protein  31.69 
 
 
408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  30.71 
 
 
403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>