37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1473 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1473  Phage-related protein endonuclease-like protein  100 
 
 		 306 aa  619  1e-176  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0602  phage-type endonuclease  50 
 
 		 311 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2619  YqaJ  48.85 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010002  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2263  hypothetical protein  45.25 
 
 		 310 aa  268  5.9999999999999995e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00963472  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0938  hypothetical protein  48.15 
 
 		 303 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0866  hypothetical protein  39.62 
 
 		 374 aa  208  8e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.896574  normal  0.759302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1657  hypothetical protein  39.24 
 
 		 342 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1620  hypothetical protein  38.98 
 
 		 374 aa  206  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2356  hypothetical protein  38.73 
 
 		 368 aa  202  5e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0622812  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1183  Phage-related protein endonuclease-like protein  39.87 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2726  hypothetical protein  35.78 
 
 		 331 aa  199  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.302744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0204  GP47  38.02 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0110  hypothetical protein  35.87 
 
 		 358 aa  192  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2448  hypothetical protein  35.13 
 
 		 342 aa  192  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2495  hypothetical protein  38.29 
 
 		 334 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3684  hypothetical protein  36.42 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4743  phage-related protein endonuclease-like protein  38.61 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1345  Phage-related protein endonuclease-like protein  35.19 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000265319  decreased coverage  0.000101887 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3739  putative phage-related protein  33.23 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00326083  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0982  hypothetical protein  33.03 
 
 		 338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000285055  hitchhiker  0.0000282178 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3414  Phage-related protein endonuclease-like protein  41.36 
 
 		 303 aa  155  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0329559 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0602  phage-type endonuclease  36.17 
 
 		 247 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0373  Phage-related protein endonuclease-like protein  43.62 
 
 		 136 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.743719 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1286  hypothetical protein  26.67 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0110  putative phage-type endonuclease  27.1 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.300181 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0099  hypothetical protein  27.57 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344559  hitchhiker  0.000179281 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4009  hypothetical protein  24.69 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3048  phage-related protein predicted endonuclease-like protein  23.85 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00171886  normal  0.0334909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2639  phage-related protein endonuclease-like protein  24.36 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4068  Phage-related protein endonuclease-like  26.79 
 
 		 334 aa  53.1  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6976  phage-related protein endonuclease-like protein  23.86 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3585  hypothetical protein  24.2 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2700  Phage-related protein endonuclease-like  24.5 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6282  phage-related protein endonuclease-like protein  24.72 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.43147  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6182  predicted protein  25.27 
 
 		 189 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_6183  predicted protein  25.27 
 
 		 189 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0591  hypothetical protein  22.76 
 
 		 310 aa  43.5  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>