33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1406 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1406  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  100 
 
 		 200 aa  388  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.186754  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1706  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  46.59 
 
 		 200 aa  153  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1633  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  46.02 
 
 		 200 aa  152  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1168  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  32.56 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.574508  normal  0.691996 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0578  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  31.72 
 
 		 229 aa  94  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3548  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  35 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169533  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4791  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  34.97 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0109345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1468  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  32.02 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0920919  normal  0.210072 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1620  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  33.15 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.60586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3346  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  32.97 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.407599  normal  0.422144 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2756  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  32.97 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2566  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  34.08 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3664  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  29.25 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.182615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  30.26 
 
 		 326 aa  53.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3951  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  25.32 
 
 		 331 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3282  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  27.27 
 
 		 345 aa  49.7  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000131968  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0063  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.29 
 
 		 947 aa  49.3  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0382  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  35.16 
 
 		 242 aa  47.4  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00459549  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0915  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  26.55 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0114255  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1395  hypothetical protein  32.63 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1842  hypothetical protein  30.53 
 
 		 304 aa  45.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0893  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  25.84 
 
 		 241 aa  45.1  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.272819  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0506  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  46.81 
 
 		 150 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000294811  hitchhiker  0.0000357823 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1609  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  27.69 
 
 		 254 aa  43.5  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0262553  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3818  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.38 
 
 		 930 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2484  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.43 
 
 		 931 aa  43.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3982  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32 
 
 		 932 aa  42.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.728427 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2849  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.45 
 
 		 933 aa  42.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.99 
 
 		 959 aa  42.4  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26930  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  28.18 
 
 		 964 aa  42  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0148586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11050  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.48 
 
 		 957 aa  42  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217743  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3625  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.81 
 
 		 962 aa  41.2  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12080  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  33.72 
 
 		 241 aa  41.2  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>