86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0804 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0804  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  100 
 
 		 107 aa  203  6e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4786  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  38.83 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1639  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  43.02 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2572  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  38 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1712  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.02 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3542  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  36.89 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148667  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  36 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.273986 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1162  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  38 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.660845  normal  0.977203 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2762  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  34.31 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  34.31 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0554454  normal  0.387715 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1614  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  34.31 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  34.65 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000428364  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0579  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.01 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1215  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  31.53 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1352  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.77 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.687552  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2211  membrane bound protein complex subunit mbxG  28.18 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.756272  normal  0.135903 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12070  NADH dehydrogenase I subunit K  32.35 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000348654  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0670  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  30.84 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0792  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  28.3 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1608  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  30 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.439148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4835  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  26.27 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2862  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  27.52 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0938  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.43 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2162  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  24.58 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1841  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  27.08 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.682129  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0507  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  29.25 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105387  hitchhiker  0.0000332373 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1041  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.31 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.371299  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2585  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  33.04 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0876  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.31 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000659238 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1780  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.31 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1282  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  27.96 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1636  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  29 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1358  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.07 
 
 		 117 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.158438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2285  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  29.29 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2968  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  26 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1002  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  28.05 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3952  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  26 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0843  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  25.89 
 
 		 164 aa  47  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0864644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1396  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  27.84 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0892  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.5 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0510919  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  25.81 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0536  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  40.51 
 
 		 115 aa  47  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1036  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.76 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0560094 
 
 
-
 
NC_002978  WD1299  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.03 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.11215  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0032  Na(+)/H(+) antiporter subunit C  31.65 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0045  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.43 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2850  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  34.25 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3448  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  25.23 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.458831  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0556  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28.97 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2740  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  33.78 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.287866  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3983  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.59 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2664  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  25.33 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19540  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  25.27 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00361637  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3714  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  37.97 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0742  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  26.67 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3448  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  37.97 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.378058 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5268  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  37.84 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1288  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  27.08 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.97867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18960  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhC subunit  30.14 
 
 		 185 aa  42.7  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1583  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  34.38 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0581  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.89 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0234647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3856  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28.71 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1442  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  27.17 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3283  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  25.51 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0233642  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3665  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  25.51 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0031  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.08 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  32 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0950  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  36.71 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6654  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhC subunit- like protein  31.51 
 
 		 272 aa  42  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0969  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  36.71 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2872  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28.42 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0149  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.33 
 
 		 120 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1161  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.14 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5102  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  26.53 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3624  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  35.44 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3129  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  34.04 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0469  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  25.93 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1743  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  28.4 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1770  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  23.68 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0954  hypothetical protein  31.19 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0333861  normal  0.110098 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0750  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  26 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0132388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0436  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  42.86 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0501  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  42.86 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.141037  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2485  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  34.15 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1773  Na(+)/H(+) antiporter subunit C  28.26 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0402  hypothetical protein  28.26 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>