18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0455 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0455  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  509  1e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0456  hypothetical protein  38.96 
 
 
264 aa  149  5e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1185  hypothetical protein  32.82 
 
 
268 aa  135  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1443  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.06 
 
 
265 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151411  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0190  hypothetical protein  27.55 
 
 
266 aa  102  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2157  hypothetical protein  26.24 
 
 
264 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4578  putative ABC transporter, permease component  24.25 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000593867  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1721  hypothetical protein  24.25 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1779  ABC transporter, permease protein, putative  24.25 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120662  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2158  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.2 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.82128  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0090  ABC-2 type transporter  21.28 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7393  hypothetical protein  22.98 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0354  hypothetical protein  19.29 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1244  hypothetical protein  22.07 
 
 
260 aa  48.9  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2742  conserved hypothetical protein  30.94 
 
 
277 aa  47  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.300363  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1616  ABC transporter, permease protein  21.08 
 
 
268 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000619745  hitchhiker  0.000000421446 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2984  hypothetical protein  20.74 
 
 
265 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3701  ABC transporter, permease protein  20.54 
 
 
268 aa  42  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000237165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>