17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3005 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_3005  hypothetical protein  100 
 
 
516 aa  1043    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4611  protein of unknown function DUF88  55.71 
 
 
574 aa  526  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0253473  normal  0.838732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0396  hypothetical protein  60.39 
 
 
393 aa  266  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0226  protein of unknown function DUF88  72.16 
 
 
446 aa  143  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0183  hypothetical protein  70.65 
 
 
468 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0923837  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5741  protein of unknown function DUF88  39.11 
 
 
435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0769701  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1151  hypothetical protein  38.03 
 
 
388 aa  101  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.111113  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3359  hypothetical protein  34.55 
 
 
404 aa  99.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4132  protein of unknown function DUF88  36.67 
 
 
333 aa  96.3  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0698  hypothetical protein  34.29 
 
 
304 aa  95.9  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1318  hypothetical protein  33.33 
 
 
313 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0791  hypothetical protein  34.04 
 
 
335 aa  93.2  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13215  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2603  hypothetical protein  36.84 
 
 
277 aa  79.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1748  hypothetical protein  31.11 
 
 
284 aa  53.9  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  32.21 
 
 
181 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0992  protein of unknown function DUF88  24.72 
 
 
195 aa  44.3  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0033  hypothetical protein  28.8 
 
 
216 aa  43.9  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0895202 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>