16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2921 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2921  hypothetical protein  100 
 
 
581 aa  1164    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4324  hypothetical protein  56.33 
 
 
613 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0929  hypothetical protein  46.46 
 
 
547 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0961263  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0661  hypothetical protein  44.08 
 
 
573 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0484  hypothetical protein  45.09 
 
 
498 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0480409  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0859  hypothetical protein  36.08 
 
 
549 aa  243  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00278552  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2765  hypothetical protein  33.27 
 
 
634 aa  225  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1248  Protein of unknown function DUF2207, membrane  33.77 
 
 
652 aa  207  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1466  hypothetical protein  27.25 
 
 
465 aa  116  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1259  membrane protein-like protein  25.22 
 
 
649 aa  113  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3926  hypothetical protein  27.37 
 
 
360 aa  63.9  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0464  hypothetical protein  22.48 
 
 
566 aa  62  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12710  predicted membrane protein  23.82 
 
 
662 aa  58.2  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.942677  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0093  membrane protein-like protein  24.17 
 
 
667 aa  51.6  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4521  membrane-like protein  31.82 
 
 
656 aa  48.9  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180216  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2636  putative transmembrane signal peptide protein  29.27 
 
 
626 aa  48.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>