More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1666 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1666  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  100 
 
 
700 aa  1404    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3761  para-aminobenzoate synthase  52.23 
 
 
703 aa  682    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0331515  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2111  para-aminobenzoate synthase, subunit I  65 
 
 
687 aa  815    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0378177  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1766  para-aminobenzoate synthase, subunit I  53.06 
 
 
718 aa  667    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.556593 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0310  para-aminobenzoate synthase subunit I  44.27 
 
 
731 aa  604  1.0000000000000001e-171  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.764542  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3468  anthranilate synthase, component II  45.48 
 
 
714 aa  592  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.841955  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.87 
 
 
732 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00431194  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1366  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.84 
 
 
762 aa  584  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0518359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1044  para-aminobenzoate synthase, component I  44.77 
 
 
704 aa  570  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.869303  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0951  para-aminobenzoate synthase, component I  43.86 
 
 
705 aa  559  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.754558  normal  0.679604 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4583  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.67 
 
 
732 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3391  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.5 
 
 
637 aa  539  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2897  para-aminobenzoate synthase, component I  45.62 
 
 
686 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0159595  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5650  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.76 
 
 
672 aa  525  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42151  predicted protein  39.53 
 
 
760 aa  412  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.062393 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.5 
 
 
721 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1828  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.44 
 
 
518 aa  334  4e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.388219 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05730  4-amino-4-deoxychorismate synthase, putative  33.42 
 
 
809 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74393  para-aminobenzoate synthase, (PABA)  29.7 
 
 
769 aa  303  6.000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0953381 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3848  anthranilate synthase, component II / anthranilate synthase, component I  42.12 
 
 
682 aa  280  7e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3635  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.96 
 
 
719 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  38.3 
 
 
471 aa  265  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2208  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.09 
 
 
461 aa  261  4e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0392675  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  39.19 
 
 
468 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3582  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.01 
 
 
474 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00051468  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  38.36 
 
 
466 aa  251  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1191  anthranilate synthase component I  39.33 
 
 
487 aa  251  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00517718  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06300  aminodeoxychorismate synthase, component I  45.73 
 
 
527 aa  251  4e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0721872  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2489  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.52 
 
 
450 aa  250  7e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.995596  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4276  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.18 
 
 
466 aa  244  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3907  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.98 
 
 
472 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177197  normal  0.165975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.31 
 
 
446 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2860  anthranilate synthase component I  36.89 
 
 
497 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167727  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1162  anthranilate synthase component I  38.67 
 
 
485 aa  243  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1042  anthranilate synthase component I  36.64 
 
 
496 aa  243  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  35.22 
 
 
495 aa  243  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.54 
 
 
482 aa  243  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151682  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.05 
 
 
446 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053464 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2571  anthranilate synthase component I  36.7 
 
 
497 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0534  anthranilate synthase component I  36.7 
 
 
497 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0506  anthranilate synthase component I  36.7 
 
 
497 aa  241  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.978551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3621  anthranilate synthase component I  36.48 
 
 
497 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.34 
 
 
460 aa  239  9e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0940  anthranilate synthase component I  36.44 
 
 
522 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0533  anthranilate synthase component I  36.44 
 
 
497 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137643  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3575  anthranilate synthase component I  36.44 
 
 
522 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.889198  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3556  anthranilate synthase component I  36.44 
 
 
522 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317199  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0644  anthranilate synthase component I  36.44 
 
 
522 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1910  anthranilate synthase component I  36.44 
 
 
522 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3583  anthranilate synthase component I  36.44 
 
 
522 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0463  anthranilate synthase component I  36.26 
 
 
497 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.612638  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0439  anthranilate synthase component I  36.26 
 
 
497 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.629503  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3614  para-aminobenzoate synthase component I  38.24 
 
 
497 aa  238  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4120  anthranilate synthase, component I  35.97 
 
 
489 aa  238  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.57 
 
 
447 aa  238  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000783335 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.06 
 
 
447 aa  237  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389074  hitchhiker  0.0000000000236319 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  38.29 
 
 
462 aa  237  7e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3994  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.02 
 
 
493 aa  236  8e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.906481  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.33 
 
 
447 aa  236  8e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.29 
 
 
480 aa  236  8e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1122  anthranilate synthase, component I  34.88 
 
 
496 aa  236  8e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00596141  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.64 
 
 
741 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1455  anthranilate synthase component I  37.3 
 
 
514 aa  236  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.686129 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3888  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.86 
 
 
480 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.353677  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01782  para-aminobenzoate synthase component I  37.04 
 
 
453 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2073  aminodeoxychorismate synthase  37.04 
 
 
453 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2040  para-aminobenzoate synthase component I  37.04 
 
 
453 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4527  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  39.39 
 
 
437 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2369  anthranilate synthase component I  34.77 
 
 
493 aa  235  3e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1255  anthranilate synthase component I  36.07 
 
 
500 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1902  para-aminobenzoate synthase component I  36.79 
 
 
453 aa  233  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2381  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.28 
 
 
455 aa  232  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2909  anthranilate synthase component I  36.42 
 
 
522 aa  233  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2541  aminodeoxychorismate synthase  36.7 
 
 
453 aa  232  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.169515  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2120  anthranilate synthase component I  34.57 
 
 
503 aa  232  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.016796 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2698  anthranilate synthase component I  35.56 
 
 
497 aa  232  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4379  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.19 
 
 
472 aa  232  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  47.55 
 
 
408 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1376  aminodeoxychorismate synthase  36.54 
 
 
453 aa  231  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.661176  normal  0.079748 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2398  para-aminobenzoate synthase, subunit I  52.34 
 
 
457 aa  231  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2156  anthranilate synthase component I  36.36 
 
 
517 aa  231  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.849379  hitchhiker  0.00323016 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2082  anthranilate synthase component I  37.64 
 
 
491 aa  231  4e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1831  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.54 
 
 
453 aa  230  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1821  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.54 
 
 
453 aa  230  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  39.15 
 
 
454 aa  230  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3078  anthranilate synthase component I  35.98 
 
 
535 aa  230  7e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00101032  hitchhiker  0.000123729 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01770  hypothetical protein  36.87 
 
 
445 aa  230  7e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.994837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0064  para-aminobenzoate synthase component I  35.98 
 
 
465 aa  230  7e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  40.16 
 
 
471 aa  230  7e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  38.48 
 
 
454 aa  230  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  35.87 
 
 
458 aa  230  8e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  39.15 
 
 
454 aa  230  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0461  anthranilate synthase component I  36.02 
 
 
497 aa  230  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1636  para-aminobenzoate synthase component I  34.42 
 
 
458 aa  229  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3496  anthranilate synthase component I  35.87 
 
 
497 aa  229  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.703327  hitchhiker  0.000325099 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2353  para-aminobenzoate synthase, component I  34.42 
 
 
458 aa  229  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  36.23 
 
 
453 aa  229  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1627  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.47 
 
 
458 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.18817  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1094  para-aminobenzoate synthase, component I  37.43 
 
 
448 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0293848  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3463  anthranilate synthase component I  35.76 
 
 
491 aa  228  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0715652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>