24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2758 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2758  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  303  5.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000647849  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0368  hypothetical protein  60.8 
 
 
140 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4368  hypothetical protein  54.81 
 
 
147 aa  159  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0509  hypothetical protein  57.14 
 
 
141 aa  155  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1785  hypothetical protein  41.04 
 
 
136 aa  100  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0273251  normal  0.172836 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2674  putative cytoplasmic protein  29.01 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2232  hypothetical protein  30.83 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843769  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2632  hypothetical protein  32.04 
 
 
152 aa  57  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1691  hypothetical protein  27.78 
 
 
134 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3311  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.26 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0772  ferredoxin  30.56 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0665  hypothetical protein  29.84 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0649  hypothetical protein  29.84 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2045  hypothetical protein  28.24 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  28.57 
 
 
356 aa  49.7  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1934  hypothetical protein  25.19 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.896486 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1766  hypothetical protein  27.48 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3531  hypothetical protein  25.19 
 
 
135 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  28.37 
 
 
355 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2617  hypothetical protein  27.2 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  26.52 
 
 
349 aa  44.3  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  26.62 
 
 
360 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0923  hypothetical protein  26.24 
 
 
134 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2883  hypothetical protein  26.96 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>