17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2309 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2309  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  435  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.141786 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4409  hypothetical protein  36.95 
 
 
362 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0502  hypothetical protein  39.23 
 
 
189 aa  111  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0086  hypothetical protein  37.64 
 
 
175 aa  105  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2617  hypothetical protein  37.42 
 
 
185 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3486  hypothetical protein  36.2 
 
 
185 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.641158  normal  0.334004 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0391  hypothetical protein  39.16 
 
 
181 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4631  peptidase A2A retrovirus catalytic  33.33 
 
 
220 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3083  hypothetical protein  33.04 
 
 
391 aa  52.4  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3935  hypothetical protein  28.21 
 
 
361 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00372357  hitchhiker  0.000463304 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0455  hypothetical protein  28.08 
 
 
193 aa  48.1  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00290  hypothetical protein  30.4 
 
 
304 aa  45.8  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0907  putative transmembrane signal peptide protein  30.4 
 
 
230 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0170092  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0868  putative transmembrane signal peptide protein  30.4 
 
 
230 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.174199 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1975  putative transmembrane signal peptide protein  29.2 
 
 
230 aa  42.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2449  hypothetical protein  38.89 
 
 
298 aa  41.6  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0789  hypothetical protein  27.44 
 
 
291 aa  41.6  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>