17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4673 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4673  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
170 aa  322  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 
116 aa  50.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  36.79 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0791  anti-sigma-factor antagonist  30.12 
 
 
111 aa  47.4  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 
115 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.04 
 
 
113 aa  45.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 
112 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  38.1 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  24.51 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  37.66 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  35.19 
 
 
112 aa  42.4  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  41.27 
 
 
113 aa  41.6  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  25.53 
 
 
111 aa  41.6  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  32.53 
 
 
116 aa  41.2  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  30.12 
 
 
116 aa  40.8  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  30.59 
 
 
116 aa  40.8  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3997  anti-sigma-factor antagonist  38.03 
 
 
113 aa  40.4  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>