33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1336 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1336  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  262  8.999999999999999e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1548  hypothetical protein  54.76 
 
 		 126 aa  155  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.466583  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0576  hypothetical protein  51.61 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3102  hypothetical protein  46.4 
 
 		 125 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3356  hypothetical protein  46.83 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3250  hypothetical protein  46.56 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3149  hypothetical protein  46.51 
 
 		 132 aa  131  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0873  hypothetical protein  46.51 
 
 		 132 aa  130  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3715  hypothetical protein  47.58 
 
 		 125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2854  hypothetical protein  43.31 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3682  hypothetical protein  44.96 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2981  hypothetical protein  45.67 
 
 		 127 aa  123  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1008  hypothetical protein  45.67 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3331  hypothetical protein  45.67 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1041  hypothetical protein  45.67 
 
 		 127 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1029  hypothetical protein  45.67 
 
 		 127 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.674916 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0256  hypothetical protein  37.9 
 
 		 127 aa  107  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  33.03 
 
 		 285 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3480  UspA domain protein  30.17 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1240  hypothetical protein  30.48 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.370362  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0232  hypothetical protein  30.48 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.190765  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  29.82 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3056  hypothetical protein  23.81 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.3077  normal  0.011343 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  26.5 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1109  hypothetical protein  31.43 
 
 		 122 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6777  hypothetical protein  22.33 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0884  hypothetical protein  25.47 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0045  hypothetical protein  25.47 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000429273 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  24.77 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2602  hypothetical protein  28.18 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2063  hypothetical protein  29.36 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1481  hypothetical protein  30.36 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  24.55 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>