More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1161 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1161  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  673    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.18822  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3172  hypothetical protein  38.08 
 
 		 333 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102896  normal  0.287439 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3401  hypothetical protein  38.7 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30360  hypothetical protein  39.13 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3602  hypothetical protein  38.08 
 
 		 333 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1665  hypothetical protein  39.27 
 
 		 332 aa  226  6e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3342  glycosyl transferase, putative  37.69 
 
 		 333 aa  225  9e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534413  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3997  hypothetical protein  37.15 
 
 		 333 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.937914  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2599  hypothetical protein  38.51 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.733501  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1836  hypothetical protein  37.15 
 
 		 333 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000267985 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28160  hypothetical protein  37.23 
 
 		 328 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3579  hypothetical protein  36.34 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03656  hypothetical protein  34.78 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2381  hypothetical protein  36.84 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.0161209 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2530  hypothetical protein  30.84 
 
 		 361 aa  179  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2812  glycosyl transferase family protein  36.45 
 
 		 337 aa  176  7e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3046  hypothetical protein  33.74 
 
 		 319 aa  145  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0326711  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1507  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1809  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 		 408 aa  143  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4280  hypothetical protein  30.28 
 
 		 506 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0848  hypothetical protein  32.43 
 
 		 334 aa  142  7e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05584  hypothetical protein  33.74 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001604  glycosyl transferase family 3  33.33 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1670  hypothetical protein  30.25 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0478591  normal  0.302071 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1873  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 		 376 aa  136  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.597248  hitchhiker  0.00000310641 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2767  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 		 390 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.0391357 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3794  hypothetical protein  28.76 
 
 		 491 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516461  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2882  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2358  Anthranilate phosphoribosyltransferase  32 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1403  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.508618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3531  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0253  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.186746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0815  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 		 329 aa  87  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303571  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0234  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 		 336 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3280  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1689  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.67 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.304746  normal  0.0692576 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0378  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2104  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0754859  normal  0.466514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3624  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.96 
 
 		 366 aa  79.3  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0274  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.226663 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.87 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0477  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.31 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2293  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129801  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1671  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.91 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.194184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4051  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.64 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1003  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1116  anthranilate phosphoribosyltransferase  23.61 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2842  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4143  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1586  Anthranilate phosphoribosyltransferase  25.38 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2331  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0852797  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1293  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.408339  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2320  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101648  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3133  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2916  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1487  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0102  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0738  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0555  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0575  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596232  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2690  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335373 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2142  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.75 
 
 		 339 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0570  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1146  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.31 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0873  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.22 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0865  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.11 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1160  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.94 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2471  hypothetical protein  25.09 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1867  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.67 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1872  anthranilate phosphoribosyltransferase  23.05 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0896  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.38 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0490  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3637  hypothetical protein  25.45 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0158  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.86 
 
 		 376 aa  69.3  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal  0.0330567 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0504  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.98 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1567  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.28 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.315366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1358  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.3 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4580  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.81 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00120881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1397  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.97 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000237469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3885  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.83 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2729  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3302  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.92 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15761  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.07 
 
 		 370 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2814  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.97 
 
 		 333 aa  67  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1980  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1638  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 		 338 aa  67  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1774  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.11 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0327  glycosyl transferase family protein  23.98 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2871  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1046  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.42 
 
 		 349 aa  67  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1444  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.49 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0160  anthranilate phosphoribosyltransferase  21.71 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0593  anthranilate phosphoribosyltransferase  23.97 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.973159  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3065  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.56 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00243568  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2892  Anthranilate phosphoribosyltransferase  24.46 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1318  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.56 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000112506 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1158  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.56 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1138  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.56 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1762  Anthranilate phosphoribosyltransferase  25.85 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1250  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.56 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>