39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0848 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0848  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06111  hypothetical protein  41.03 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.46293 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1886  hypothetical protein  41.03 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0762  hypothetical protein  37.5 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.125216 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05591  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  38.46 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2642  hypothetical protein  37.5 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1604  hypothetical protein  34.62 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08161  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  36.25 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06121  hypothetical protein  31.51 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.428426  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06201  hypothetical protein  32 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05821  hypothetical protein  30.14 
 
 		 79 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3193  hypothetical protein  38.57 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183625  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0913  hypothetical protein  33.96 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0556  hypothetical protein  28 
 
 		 79 aa  48.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.198822  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8574  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.14 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224719  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1266  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.62 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.421777  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1979  hypothetical protein  37.04 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0006  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  29.63 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.251541  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1849  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0456582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1008  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  38.03 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1320  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.58 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29375  predicted protein  28.57 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.744138  normal  0.395144 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0868  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.43 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4341  hypothetical protein  34.94 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0862  putative pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase (PHS)  36.36 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0417  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  39.22 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0306191  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0631  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.77 
 
 		 113 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00151713  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1681  hypothetical protein  36.36 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.747789  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1379  hypothetical protein  36.36 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1412  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.33 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0351237 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3581  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.51 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635691  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2085  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.43 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1646  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.94 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0328743 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0128  hypothetical protein  38.57 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2173  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.43 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2086  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.96 
 
 		 256 aa  40.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349534  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1975  hypothetical protein  25.64 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0497  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30.67 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.715149  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1980  hypothetical protein  25.64 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>