16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2034 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2034  hemerythrin hhE cation binding domain-containing protein  100 
 
 
216 aa  418  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.568645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5843  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  39.51 
 
 
213 aa  128  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.737154  normal  0.680441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3557  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.5 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0785  hypothetical protein  35.45 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1243  hypothetical protein  34.48 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6523  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.67 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0499  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.56 
 
 
222 aa  61.6  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0736  hypothetical protein  31.43 
 
 
213 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388253  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.14 
 
 
747 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0619  hypothetical protein  28.36 
 
 
169 aa  55.8  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0955  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.91 
 
 
236 aa  55.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7884  hypothetical protein  29.7 
 
 
212 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.765433  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0699  hypothetical protein  28.57 
 
 
146 aa  52.4  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5446  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.71 
 
 
215 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  32.2 
 
 
437 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1636  Luciferase-like monooxygenase  30.67 
 
 
519 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0262189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>