26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1186 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1186  Peptidase M23  100 
 
 
274 aa  549  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247646  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2350  hypothetical protein  49.66 
 
 
291 aa  269  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0199  peptidase M23B  41.83 
 
 
246 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0227  peptidase M23B  46.39 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0890169  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1343  peptidase M23B  40.3 
 
 
271 aa  125  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4760  peptidase M23B  35.61 
 
 
295 aa  115  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2717  Peptidase M23  28.99 
 
 
272 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153286  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3804  peptidase M23B  41.54 
 
 
199 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.019155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2227  peptidase M23B  37.04 
 
 
172 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  38.96 
 
 
339 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0489  peptidase M23B  32.2 
 
 
194 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171109  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0146  Peptidase M23  28.8 
 
 
230 aa  47.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  36.36 
 
 
340 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73200  hypothetical protein  43.1 
 
 
169 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  36.36 
 
 
340 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  36.36 
 
 
340 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  42.37 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01485  peptidase  36.36 
 
 
377 aa  43.5  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2548  Peptidase M23  36.46 
 
 
285 aa  43.9  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000368536  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3011  Peptidase M23  24.83 
 
 
223 aa  43.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0127254 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  36.36 
 
 
339 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  31.4 
 
 
392 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3437  Peptidase M23  34.41 
 
 
296 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112257  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  30.2 
 
 
345 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2214  peptidase M23B  33.33 
 
 
198 aa  42.7  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.250038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  32.61 
 
 
268 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>