22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0349 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0349  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  555  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7418  hypothetical protein  61.68 
 
 
274 aa  317  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4528  hypothetical protein  57.62 
 
 
274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4766  hypothetical protein  46.86 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0577  hypothetical protein  45.22 
 
 
253 aa  191  9e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448696  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0369  hypothetical protein  39.05 
 
 
270 aa  183  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1854  hypothetical protein  41.73 
 
 
247 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1563  hypothetical protein  38.38 
 
 
249 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688217  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2428  hypothetical protein  42.38 
 
 
257 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03250  hypothetical protein  40.36 
 
 
251 aa  149  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3675  hypothetical protein  34.11 
 
 
286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.134114 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1967  hypothetical protein  37.7 
 
 
254 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0078647  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02380  hypothetical protein  36.05 
 
 
263 aa  90.5  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6794  hypothetical protein  35.98 
 
 
256 aa  89.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10050  hypothetical protein  33.02 
 
 
273 aa  87.4  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.695793  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0575  hypothetical protein  28.2 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3703  hypothetical protein  31.8 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06150  hypothetical protein  27.44 
 
 
285 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0284078  hitchhiker  0.0068858 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2954  hypothetical protein  27.27 
 
 
297 aa  63.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1027  hypothetical protein  31.07 
 
 
279 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3048  hypothetical protein  26.48 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1929  hypothetical protein  27.14 
 
 
288 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>