13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1967 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1967  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0078647  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4528  hypothetical protein  38.2 
 
 
274 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7418  hypothetical protein  38.55 
 
 
274 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0349  hypothetical protein  38.02 
 
 
278 aa  105  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4766  hypothetical protein  32.81 
 
 
252 aa  98.6  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0577  hypothetical protein  34.44 
 
 
253 aa  86.3  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448696  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2428  hypothetical protein  37.93 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0369  hypothetical protein  29.5 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1854  hypothetical protein  29.55 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1563  hypothetical protein  28.12 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688217  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03250  hypothetical protein  33.33 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3675  hypothetical protein  27.92 
 
 
286 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.134114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6794  hypothetical protein  32.12 
 
 
256 aa  42  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>