17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3048 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3048  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  576  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2954  hypothetical protein  33.9 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0575  hypothetical protein  29.54 
 
 		 285 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06150  hypothetical protein  29.18 
 
 		 285 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0284078  hitchhiker  0.0068858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3703  hypothetical protein  31.96 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1027  hypothetical protein  30.26 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4766  hypothetical protein  28.36 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0349  hypothetical protein  26.48 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7418  hypothetical protein  30.21 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1563  hypothetical protein  26.84 
 
 		 249 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688217  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0577  hypothetical protein  25.09 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4693  hypothetical protein  26.17 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3675  hypothetical protein  31.78 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.134114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0884  hypothetical protein  25.8 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02380  hypothetical protein  31.07 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1854  hypothetical protein  27.5 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1929  hypothetical protein  34.34 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>