22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0575 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0575  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06150  hypothetical protein  97.19 
 
 		 285 aa  557  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0284078  hitchhiker  0.0068858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3703  hypothetical protein  30.71 
 
 		 274 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3048  hypothetical protein  29.14 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2954  hypothetical protein  28.99 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0349  hypothetical protein  28.2 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1854  hypothetical protein  28.52 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3675  hypothetical protein  25 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.134114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1563  hypothetical protein  27.93 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688217  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03250  hypothetical protein  29.85 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4528  hypothetical protein  26.52 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1929  hypothetical protein  26.55 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4766  hypothetical protein  28.09 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2428  hypothetical protein  25.54 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1027  hypothetical protein  26.81 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0577  hypothetical protein  27.24 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7418  hypothetical protein  24.36 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4693  hypothetical protein  24.19 
 
 		 271 aa  49.3  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10050  hypothetical protein  23.51 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.695793  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3324  hypothetical protein  19.72 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0969636  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02380  hypothetical protein  31.91 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0369  hypothetical protein  24.86 
 
 		 270 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>