17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02380 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_02380  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  508  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6794  hypothetical protein  49.81 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3675  hypothetical protein  35.64 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.134114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4766  hypothetical protein  38.33 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0349  hypothetical protein  35.91 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1563  hypothetical protein  37.7 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688217  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7418  hypothetical protein  34.88 
 
 		 274 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0577  hypothetical protein  34.15 
 
 		 253 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4528  hypothetical protein  36.4 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0369  hypothetical protein  31.32 
 
 		 270 aa  94  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2428  hypothetical protein  36.47 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1854  hypothetical protein  34.02 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03250  hypothetical protein  34.55 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3048  hypothetical protein  31.07 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1027  hypothetical protein  26.42 
 
 		 279 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1967  hypothetical protein  32.2 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0078647  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0575  hypothetical protein  31.91 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>