20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_06150 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_06150  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0284078  hitchhiker  0.0068858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0575  hypothetical protein  97.19 
 
 
285 aa  557  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3703  hypothetical protein  30.36 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3048  hypothetical protein  29.14 
 
 
285 aa  90.1  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2954  hypothetical protein  28.99 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0349  hypothetical protein  27.44 
 
 
278 aa  79  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1854  hypothetical protein  28.17 
 
 
247 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3675  hypothetical protein  24.28 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.134114 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03250  hypothetical protein  29.85 
 
 
251 aa  62.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1563  hypothetical protein  28.52 
 
 
249 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688217  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4528  hypothetical protein  26.52 
 
 
274 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4766  hypothetical protein  28.46 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1027  hypothetical protein  26.81 
 
 
279 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7418  hypothetical protein  24.36 
 
 
274 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0577  hypothetical protein  26.12 
 
 
253 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448696  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2428  hypothetical protein  25.54 
 
 
257 aa  56.2  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1929  hypothetical protein  25.45 
 
 
288 aa  53.1  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4693  hypothetical protein  23.83 
 
 
271 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10050  hypothetical protein  23.51 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.695793  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3324  hypothetical protein  19.72 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0969636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>