14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10050 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_10050  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  539  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.695793  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03250  hypothetical protein  39.26 
 
 
251 aa  116  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0577  hypothetical protein  34.8 
 
 
253 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448696  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0349  hypothetical protein  32.07 
 
 
278 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4528  hypothetical protein  34.27 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2428  hypothetical protein  32.19 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4766  hypothetical protein  33.07 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7418  hypothetical protein  31.53 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1854  hypothetical protein  32.98 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1563  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688217  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0575  hypothetical protein  23.9 
 
 
285 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06150  hypothetical protein  23.51 
 
 
285 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0284078  hitchhiker  0.0068858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6794  hypothetical protein  28.93 
 
 
256 aa  45.8  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0369  hypothetical protein  26.1 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>