17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0284 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0284  hypothetical protein  100 
 
 		 511 aa  1041    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2508  PEP-CTERM system associated protein  30.86 
 
 		 513 aa  200  6e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.831651 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2526  hypothetical protein  29.76 
 
 		 528 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.215866  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0145  hypothetical protein  28.77 
 
 		 510 aa  169  8e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0661  hypothetical protein  29.6 
 
 		 518 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0515751  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2400  hypothetical protein  30.63 
 
 		 523 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.11617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2389  hypothetical protein  23.79 
 
 		 472 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3279  PEP-CTERM system associated protein  25.75 
 
 		 505 aa  87  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1519  hypothetical protein  24.29 
 
 		 496 aa  80.9  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0398559  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3506  hypothetical protein  27.5 
 
 		 495 aa  66.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132371 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1982  hypothetical protein  25.56 
 
 		 501 aa  65.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5028  hypothetical protein  23.63 
 
 		 535 aa  65.1  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3116  hypothetical protein  23.93 
 
 		 543 aa  61.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1981  hypothetical protein  31.45 
 
 		 409 aa  53.5  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2471  hypothetical protein  25.61 
 
 		 423 aa  47.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2474  PEP-CTERM system associated protein  33.57 
 
 		 417 aa  47.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1773  hypothetical protein  31.16 
 
 		 417 aa  44.3  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>