15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1948 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1948  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  257  4e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1091  hypothetical protein  35.9 
 
 
132 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0652611  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1346  hypothetical protein  28.46 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.325853  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2246  hypothetical protein  28.97 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01716  hypothetical protein  34.29 
 
 
125 aa  56.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.62979  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2976  hypothetical protein  26.23 
 
 
127 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00305374  hitchhiker  0.00646242 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1389  hypothetical protein  25.78 
 
 
126 aa  54.3  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.686491  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2087  transmembrane protein  23.28 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4218  hypothetical protein  23.28 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0331005  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54340  hypothetical protein  23.53 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4750  hypothetical protein  23.53 
 
 
125 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2459  hypothetical protein  23.6 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3952  hypothetical protein  25.84 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.637878  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1474  hypothetical protein  23.28 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.415713  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1464  hypothetical protein  24.07 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>