41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1229 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1229  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 80 aa  167  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.470338  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1535  phage transcriptional regulator, AlpA  46.67 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003286  hypothetical protein  36.67 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  40.32 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0108043 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3496  DNA binding domain protein, excisionase family  44 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2785  hypothetical protein  43.55 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407412 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  39.34 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3111  hypothetical protein  41.51 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3473  DNA binding domain protein, excisionase family  38.33 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0393  hypothetical protein  35 
 
 		 73 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.509195 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0131  hypothetical protein  39.34 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225906  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3369  hypothetical protein  39.34 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7051  hypothetical protein  41.67 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1906  hypothetical protein  47.17 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.37949  hitchhiker  0.000000190811 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3816  putative transcriptional regulator  36.92 
 
 		 93 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1909  hypothetical protein  43.4 
 
 		 90 aa  43.5  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2338  hypothetical protein  43.1 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1488  hypothetical protein  37.88 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7730  hypothetical protein  38.71 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3559  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1035  putative transcriptor regulator  34.48 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1818  hypothetical protein  41.38 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3346  hypothetical protein  39.66 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3909  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2867  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0982  hypothetical protein  34.43 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0764635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0760  hypothetical protein  37.93 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.629902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3075  putative transcriptional regulator  36.92 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3016  putative transcriptional regulator  36.92 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0711  putative transcriptional regulator  36.92 
 
 		 93 aa  40.8  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28021  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1072  hypothetical protein  48.72 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0069  hypothetical protein  41.67 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7430  hypothetical protein  37.5 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3178  putative transcriptional regulator  37.1 
 
 		 93 aa  40.4  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1608  hypothetical protein  36.21 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1297  hypothetical protein  40 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3400  excisionase/Xis, DNA-binding  40.82 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149044  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7734  hypothetical protein  39.39 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3183  putative transcriptional regulator  37.1 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0695  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3583  hypothetical protein  34.85 
 
 		 95 aa  40  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.529666 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>