21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0616 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0616  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  741    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460845  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2535  hypothetical protein  28.3 
 
 		 348 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0241479 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4605  hypothetical protein  30.36 
 
 		 361 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.372172 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2445  hypothetical protein  28.16 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2746  hypothetical protein  31.63 
 
 		 348 aa  90.5  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1207  putative hexapeptide transferase family protein  24.4 
 
 		 370 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1560  hypothetical protein  31.42 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1795  hypothetical protein  25.93 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5050  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1213 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2495  hypothetical protein  29.26 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2534  hypothetical protein  27.73 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.1398 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3276  hypothetical protein  30.57 
 
 		 390 aa  57  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1940  hypothetical protein  24.32 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2008  hypothetical protein  26.14 
 
 		 428 aa  50.1  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0424  hypothetical protein  26.92 
 
 		 440 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1131  hypothetical protein  24.71 
 
 		 391 aa  47  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2044  alpha-L-glutamate ligase-like protein  23.15 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202179  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1849  alpha-L-glutamate ligase-related protein  26.32 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0417  hypothetical protein  27.61 
 
 		 434 aa  43.9  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0049  hypothetical protein  25.64 
 
 		 412 aa  43.5  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2032  alpha-L-glutamate ligase-like protein  24.41 
 
 		 314 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>