84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2066 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2066  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  100 
 
 		 78 aa  146  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000986441  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.78 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.5 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3083  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.5 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.13 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.76 
 
 		 76 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2892  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.29 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1537  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.6 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000164588  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2321  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3492  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.84 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000422868  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00370  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1080  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000691643 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3211  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000938667 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1752  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.156195 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1416  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.35 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.18 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  38.18 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1760  Exonuclease VII small subunit  35.38 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2587  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.62 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00858119  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0851  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.339936  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0889  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3279  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1032  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1075  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.07 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00074506  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0484  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0155  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.07 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.281027  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3220  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.6 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0471  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0526  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0465  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0463  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1664  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.07 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.329844  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3327  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.74 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.779429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2202  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.99 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2788  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.62 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0306157  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0753  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 		 81 aa  42.7  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000664309  hitchhiker  0.0000311057 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1345  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.5 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230985  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1182  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0104864  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1359  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.5 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00292788  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0935  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.04 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1384  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.5 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3001  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.5 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121829  decreased coverage  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1050  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.18 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2769  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.71 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1277  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.5 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.11345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2177  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.98 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000361923  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0954  Exonuclease VII small subunit  30 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.863468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.6 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1321  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.93 
 
 		 83 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2729  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.94 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285704  normal  0.425427 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2802  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.94 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.269499  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3110  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 		 84 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2899  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.94 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152416  hitchhiker  0.000215653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01898  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 86 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.90032  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2238  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.33 
 
 		 78 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.264356 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1720  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.96 
 
 		 81 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.170328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2989  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.5 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247958  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3072  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 		 84 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0941  Exonuclease VII small subunit  38.3 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628269  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.35 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1147  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.33 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.164326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0945  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.94 
 
 		 76 aa  40.8  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582074  hitchhiker  0.000128888 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0903  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1024  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2893  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.25 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4289  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.39 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.18628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4083  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.39 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3921  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.39 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3932  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.39 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3476  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.04 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.173082  hitchhiker  0.00255329 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4403  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.39 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0852123  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.93 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4199  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.39 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5598800000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4309  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.39 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000200233  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0542  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.1 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0438  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.1 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0431  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.1 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0164  exonuclease VII, small subunit  32.84 
 
 		 102 aa  40  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.870914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  28.12 
 
 		 80 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.375138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>