13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0580 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0580  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  866    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  21.56 
 
 		 431 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  25.42 
 
 		 426 aa  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  22.69 
 
 		 497 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  23.12 
 
 		 380 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  22.63 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  50 
 
 		 331 aa  47  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  26.49 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  25.17 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1182  hypothetical protein  27.34 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.114028  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  22.22 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  21.29 
 
 		 463 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  34.38 
 
 		 308 aa  43.5  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>