58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_14044 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_14044  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  176  6e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0590766  normal  0.664397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0055  tRNA-Ser  96.63 
 
 		 92 bp  153  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0062  tRNA-Ser  96.63 
 
 		 89 bp  153  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0057  tRNA-Ser  96.63 
 
 		 92 bp  153  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0058  tRNA-Ser  96.63 
 
 		 92 bp  153  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479473  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0006  tRNA-Ser  95.51 
 
 		 89 bp  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0005  tRNA-Ser  94.38 
 
 		 89 bp  137  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0056  tRNA-Ser  89.89 
 
 		 92 bp  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0004  tRNA-Ser  97.5 
 
 		 92 bp  71.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0006  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0012  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0013  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03580  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.731888  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Pseudo-2  tRNA-OTHER  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.520192  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0008  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.382627 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0014  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0024  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0041  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0647014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0032  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.869887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0053  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.763389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0467  tRNA-Ser  88.1 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2606  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.834732  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0042  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0023  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07240  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0320556  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0028  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.243939  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0042  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0002  tRNA-Pro  96.67 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0018  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0768542  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0043  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.417054  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0023  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0024  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0056  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1901  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0011  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192635  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2581  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0434845  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0049  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.046513  normal  0.505241 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0016  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.617761  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0027  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192798  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0034  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0033  tRNA-Pro  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.614973  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0042  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0040  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0056  tRNA-Pro  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.715456  normal  0.81728 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0018  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.161643  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0033  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1528  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.359619  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0194  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.56004  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1722  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.181858  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1745  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666624  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0011  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0972  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0531228  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Pro-4  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0021  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03937  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0044  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115287  normal  0.132684 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0050  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  0.906825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>