12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0467 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0467  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  182  1e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0016  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  56  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0019  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  56  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0016  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  56  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0019  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  56  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t51  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  54  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00175911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA25  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  54  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0856542  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R24  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  54  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.902283  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0471  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  52  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0039  tRNA-Ser  91.67 
 
 
91 bp  48.1  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000237052  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  44.1  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14044  tRNA-Ser  88.1 
 
 
89 bp  44.1  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0590766  normal  0.664397 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>