18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12715 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12715  secreted alanine rich protein  100 
 
 
216 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0163225  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2464  hypothetical protein  64.68 
 
 
221 aa  295  5e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3936  hypothetical protein  65.6 
 
 
221 aa  276  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2234  hypothetical protein  64.68 
 
 
218 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108266  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2188  hypothetical protein  64.68 
 
 
218 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.880975  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2177  hypothetical protein  64.68 
 
 
218 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26652  hitchhiker  0.0018369 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1881  secreted alanine rich protein  42.37 
 
 
234 aa  146  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.961705  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2248  hypothetical protein  40.6 
 
 
232 aa  105  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3762  hypothetical protein  41.18 
 
 
232 aa  92.8  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354938  normal  0.602962 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24300  hypothetical protein  36.77 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1512  hypothetical protein  34.93 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1867  putative secreted alanine rich protein  35.05 
 
 
179 aa  59.3  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.392204  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04630  ACT domain-containing protein  35.24 
 
 
227 aa  50.1  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.424021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1477  hypothetical protein  27.01 
 
 
174 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.258499  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0234  hypothetical protein  28.27 
 
 
230 aa  45.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.79 
 
 
520 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0702  hypothetical protein  29.29 
 
 
225 aa  42.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3149  hypothetical protein  33.67 
 
 
234 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.471503  hitchhiker  0.00441902 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>