29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11934 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11934  D-amino acid oxidase aao  100 
 
 
320 aa  637    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1168  D-aspartate oxidase  44.19 
 
 
318 aa  232  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0526  D-amino acid oxidase  43.43 
 
 
326 aa  218  7.999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3499  D-amino-acid oxidase  40 
 
 
305 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1780  D-amino-acid oxidase  41.35 
 
 
310 aa  160  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09913  putative D-amino acid oxidase  31.75 
 
 
311 aa  157  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4180  D-aspartate oxidase  38.24 
 
 
315 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251055  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3505  D-aspartate oxidase  37.95 
 
 
306 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5336  predicted protein  35.92 
 
 
310 aa  133  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00372413  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4657  D-aspartate oxidase  33.99 
 
 
320 aa  112  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00174  D-amino acid oxidase (AFU_orthologue; AFUA_5G11290)  29.34 
 
 
364 aa  103  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10863  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G13940)  28.57 
 
 
347 aa  99.8  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8818  D-aspartate oxidase  28.46 
 
 
371 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3809  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
273 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00410  conserved hypothetical protein  25.98 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00330  conserved hypothetical protein  26.72 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00932753  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83340  d-amino acid oxidase  26.27 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33517  D-aspartate oxidase  25.68 
 
 
348 aa  72.8  0.000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4743  FAD dependent oxidoreductase  24.91 
 
 
382 aa  69.3  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.285459 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07187  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G10230)  26.11 
 
 
264 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01770  conserved hypothetical protein  27.89 
 
 
426 aa  55.5  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4744  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 
396 aa  53.1  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.732215  hitchhiker  0.0052696 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03030  D-amino acid oxidase  59.46 
 
 
404 aa  52.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3194  FAD dependent oxidoreductase  55.81 
 
 
390 aa  49.7  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.329567  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57912  D-amino acid oxidase  22.19 
 
 
360 aa  49.3  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.687293 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 
378 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2166  glycine oxidase ThiO  25.44 
 
 
346 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12779  predicted protein  28.85 
 
 
178 aa  43.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.644992 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 
401 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>