24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11083 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11083  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  375  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.334269999999999e-45  normal  0.140472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4168  cysteine dioxygenase type I  71.89 
 
 
176 aa  252  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4234  cysteine dioxygenase type I  71.89 
 
 
176 aa  252  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4390  cysteine dioxygenase type I  71.89 
 
 
176 aa  252  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2033  cysteine dioxygenase type I  72.51 
 
 
172 aa  246  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4684  cysteine dioxygenase type I  70.59 
 
 
171 aa  238  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0553076  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3322  cysteine dioxygenase type I  63.84 
 
 
195 aa  195  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  58.94 
 
 
294 aa  170  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1387  cysteine dioxygenase type I  52.27 
 
 
178 aa  121  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240375  normal  0.0417465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0473  cysteine dioxygenase type I  43.85 
 
 
152 aa  99.4  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1688  cysteine dioxygenase type I  40.91 
 
 
153 aa  87.8  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287539  normal  0.148043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3083  cysteine dioxygenase type I  39.61 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.569754  normal  0.0821213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1484  cysteine dioxygenase type I  37.17 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.346783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4981  cysteine dioxygenase type I  39.67 
 
 
211 aa  71.2  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.724301  normal  0.731628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1290  cysteine dioxygenase type I  32.62 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0248002  normal  0.323181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1317  cysteine dioxygenase type I  31.82 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6068  cysteine dioxygenase type I  40.71 
 
 
207 aa  62.4  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172595  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5989  cysteine dioxygenase type I  42.11 
 
 
155 aa  62  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7922  hypothetical protein  32.06 
 
 
170 aa  57.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.969512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2234  cysteine dioxygenase type I  36.54 
 
 
167 aa  57.8  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1288  cysteine dioxygenase type I  31.54 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198462  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2602  hypothetical protein  23.36 
 
 
147 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000300712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2559  cysteine dioxygenase type I superfamily  24.3 
 
 
147 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43654  cysteine dioxygenase  22.32 
 
 
225 aa  41.2  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.277874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>