64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10280 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10280  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  617  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.23814e-37  normal  0.21162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0368  hypothetical protein  72.49 
 
 
303 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644221  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0357  hypothetical protein  72.49 
 
 
303 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0378  hypothetical protein  72.49 
 
 
303 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0410  hypothetical protein  64.95 
 
 
302 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189642  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0330  hypothetical protein  72.37 
 
 
301 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.80625  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20310  hypothetical protein  57.52 
 
 
284 aa  288  9e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22051  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0423  hypothetical protein  48.61 
 
 
285 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.194905  normal  0.351436 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12266  hypothetical protein  51.48 
 
 
271 aa  255  8e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4522  Protein of unknown function DUF2236  47.94 
 
 
272 aa  244  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0247  hypothetical protein  46.52 
 
 
342 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.784413  normal  0.235589 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4848  Protein of unknown function DUF2236  45.28 
 
 
277 aa  225  7e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1497  Protein of unknown function DUF2236  43.23 
 
 
304 aa  224  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4180  Protein of unknown function DUF2236  45.69 
 
 
315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5145  hypothetical protein  47.98 
 
 
321 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5526  hypothetical protein  47.98 
 
 
343 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.940548  normal  0.383674 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5234  hypothetical protein  47.98 
 
 
343 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0324679  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4085  Protein of unknown function DUF2236  39.43 
 
 
319 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.864975  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3568  hypothetical protein  38.34 
 
 
257 aa  159  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1211  Protein of unknown function DUF2236  41.81 
 
 
282 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3288  hypothetical protein  38.26 
 
 
268 aa  152  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02678  conserved hypothetical protein  33.97 
 
 
292 aa  140  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  32.81 
 
 
281 aa  125  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  31.75 
 
 
261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08419  conserved hypothetical protein  38.95 
 
 
304 aa  113  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21310  hypothetical protein  32.68 
 
 
290 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5301  Protein of unknown function DUF2236  29.25 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0527126  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  26.79 
 
 
276 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  29.69 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  30.85 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  28.68 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  26.61 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  25.64 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  25.64 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  25.64 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  27.56 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  29.63 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3796  Protein of unknown function DUF2236  25.79 
 
 
312 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1496  Protein of unknown function DUF2236  31.78 
 
 
291 aa  63.5  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.712193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  27.43 
 
 
272 aa  62.8  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  26.29 
 
 
300 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  24.27 
 
 
302 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  23.5 
 
 
309 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10481  conserved hypothetical protein  22.34 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00162641  normal  0.337442 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2160  hypothetical protein  26.56 
 
 
281 aa  56.6  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0910299  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2969  hypothetical protein  25.73 
 
 
320 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0497  hypothetical protein  26.63 
 
 
305 aa  52.8  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414796  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  30.16 
 
 
299 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  24.75 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  26.76 
 
 
326 aa  49.3  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1349  Protein of unknown function DUF2236  29.17 
 
 
299 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  24.76 
 
 
364 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3564  Protein of unknown function DUF2236  24.84 
 
 
302 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0400782  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3252  hypothetical protein  26.4 
 
 
320 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3322  hypothetical protein  24.86 
 
 
340 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11662  hypothetical protein  24.86 
 
 
351 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.966236  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2991  hypothetical protein  24.24 
 
 
351 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0321859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  24.24 
 
 
351 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  24.24 
 
 
351 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0689  hypothetical protein  26.88 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0734  hypothetical protein  23.53 
 
 
294 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0345739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0748  hypothetical protein  23.53 
 
 
294 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0728  hypothetical protein  23.53 
 
 
294 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3536  hypothetical protein  24.24 
 
 
355 aa  43.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0180076  normal  0.258391 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>