More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1179 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1179  rubredoxin  100 
 
 
138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1239  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.83 
 
 
114 aa  157  7e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0817  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  69.39 
 
 
115 aa  151  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.187939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1857  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66.34 
 
 
111 aa  149  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4149  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  65.31 
 
 
115 aa  141  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4189  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  65.31 
 
 
115 aa  141  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45545  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3502  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.64 
 
 
113 aa  139  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.373315 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2226  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  71 
 
 
110 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.248438 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25271  putative rubredoxin  49.65 
 
 
142 aa  136  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0202  rubredoxin  50.36 
 
 
139 aa  134  4e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107628  normal  0.260868 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0229  rubredoxin  56.2 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03191  putative rubredoxin  47.97 
 
 
142 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03181  putative rubredoxin  46.67 
 
 
142 aa  116  9e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03281  putative rubredoxin  51.49 
 
 
142 aa  110  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0297  putative rubredoxin  51.49 
 
 
142 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03751  putative rubredoxin  52 
 
 
141 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.621583  normal  0.139947 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1661  putative rubredoxin  52 
 
 
141 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.250316  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03211  putative rubredoxin  40.97 
 
 
144 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9570  predicted protein  43.62 
 
 
93 aa  95.1  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.99715  normal  0.0887132 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16606  predicted protein  42.16 
 
 
130 aa  84.7  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  50.98 
 
 
227 aa  74.7  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22490  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
53 aa  70.9  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000285186  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2022  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52 
 
 
74 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1386  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.11 
 
 
62 aa  67  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0331186  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3194  rubredoxin  50 
 
 
52 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3222  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.02 
 
 
52 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.798538  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0139  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.02 
 
 
53 aa  67  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.43807 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2480  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
52 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2164  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.06 
 
 
52 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0146  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.15 
 
 
52 aa  65.1  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.497635  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0973  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.08 
 
 
52 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000469593  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2515  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
53 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310481  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1052  rubredoxin  44.23 
 
 
52 aa  63.9  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0144051  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2796  rubredoxin  42 
 
 
53 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.50585e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2533  rubrerythrin  54.55 
 
 
237 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3357  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.1 
 
 
52 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0203  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44 
 
 
52 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0414  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
52 aa  62.8  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  44 
 
 
229 aa  62.8  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1630  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44 
 
 
54 aa  62.4  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0875  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46 
 
 
52 aa  62.4  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000124351  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4424  rubrerythrin  48 
 
 
237 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2653  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 
53 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0117  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.23 
 
 
52 aa  62.8  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.403873  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0270  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.31 
 
 
53 aa  62  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460906  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0272  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.31 
 
 
53 aa  62  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000689971  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0014  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.98 
 
 
52 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.25088  normal  0.171003 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1125  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46 
 
 
53 aa  61.6  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.228048  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0253  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.31 
 
 
52 aa  61.2  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3447  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
58 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2501  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.06 
 
 
54 aa  60.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.843854  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2173  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.7 
 
 
415 aa  60.8  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.953962  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1240  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.08 
 
 
55 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0090  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.1 
 
 
52 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1473  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.75 
 
 
52 aa  60.5  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1472  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.92 
 
 
52 aa  60.5  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0886  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
57 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1197  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48 
 
 
52 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.1609  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0332  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.98 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1978  rubredoxin-like  39.34 
 
 
76 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000953598  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1538  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
237 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.029752 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1511  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
237 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2186  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.31 
 
 
52 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0152029  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2048  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.31 
 
 
52 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59994e-22 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1081  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.1 
 
 
54 aa  59.7  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0767205  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0768  rubredoxin  44.9 
 
 
53 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28841  rubredoxin:rubrerythrin:rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
235 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1457  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46 
 
 
58 aa  59.7  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296231  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2175  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.38 
 
 
52 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81123  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2295  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.31 
 
 
51 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000169241  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0147  rubredoxin  43.14 
 
 
52 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1284  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42 
 
 
53 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000469047  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1342  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.84 
 
 
54 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3080  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42 
 
 
54 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.3234  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0782  rubredoxin  44.9 
 
 
53 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3930  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.31 
 
 
53 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186647 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1245  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42 
 
 
284 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0468502  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1254  rubredoxin  43.4 
 
 
56 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
212 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0620  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44 
 
 
52 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.343902  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4069  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.31 
 
 
53 aa  58.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000133148  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0175  hypothetical protein  40.38 
 
 
51 aa  58.5  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2699  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42 
 
 
52 aa  57.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000257372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
60 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232754  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0842  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40 
 
 
63 aa  58.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000763829  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2021  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.15 
 
 
54 aa  58.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000050094  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2386  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
65 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.870937 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0101  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40 
 
 
52 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000330254  hitchhiker  1.93244e-16 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1149  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
444 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.751699 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0779  rubredoxin  38.46 
 
 
53 aa  58.2  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000850619  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.51 
 
 
476 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0677  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.83 
 
 
53 aa  57.8  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000269222  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2180  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.94 
 
 
304 aa  57.8  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0673995  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0755  rubredoxin  38.46 
 
 
53 aa  57.4  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000950456  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0689  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.75 
 
 
75 aa  57.4  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1311  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.177646  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0562  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.94 
 
 
195 aa  57  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.146358 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2937  rubredoxin  40.82 
 
 
53 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00804477  normal  0.0175439 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1582  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40 
 
 
54 aa  57  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0286  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.65 
 
 
75 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0249545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>