44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2116 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2116  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  309  1e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2435  hypothetical protein  68.46 
 
 
149 aa  227  4e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131959  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27301  thioesterase  53.38 
 
 
151 aa  170  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02481  thioesterase  41.38 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01911  thioesterase  46.38 
 
 
151 aa  137  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1541  hypothetical protein  39.86 
 
 
155 aa  133  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0175  hypothetical protein  40.97 
 
 
150 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.883072  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01931  thioesterase  40.28 
 
 
150 aa  131  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.976791  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01911  thioesterase  40.97 
 
 
150 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02021  thioesterase  39.58 
 
 
150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0211795  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1390  thioesterase superfamily protein  40.15 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0397  thioesterase superfamily protein  39.53 
 
 
148 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.995435  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1875  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
138 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1849  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
138 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1744  hypothetical protein  39.55 
 
 
136 aa  100  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0304185  normal  0.745927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0457  thioesterase superfamily protein  38.93 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4064  thioesterase superfamily protein  35.88 
 
 
138 aa  90.1  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000508078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2808  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.511725  hitchhiker  0.00696789 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  26.55 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0777  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0740  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0509002  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1596  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186946 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0777  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1267  thioesterase superfamily protein  20.87 
 
 
139 aa  47  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000790915  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3458  thioesterase superfamily protein  24.77 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  24.06 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3039  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  21.78 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1938  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 
141 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.650407 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2192  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.947686  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1492  putative thioesterase  26.02 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299251  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0657  thioesterase superfamily protein  31.18 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  24.03 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  22.7 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1215  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.92 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0724  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  22.7 
 
 
134 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.763036  normal  0.174534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1993  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 
137 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11031  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  24.42 
 
 
139 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.212306  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30 
 
 
150 aa  41.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.95 
 
 
134 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  24.16 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  24.37 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3072  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  18.27 
 
 
169 aa  40.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.495384 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.54 
 
 
133 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.54 
 
 
133 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>